Человека из проекта 1000 геномов людей

Отметим, это только приблизительный анализ, так как для более точного анализа

необходимы варианты из регионов генома находящихся под нейтральным отбором, а у нас экзомные данные.

Тем не менее с использованием 5708 вариантов для M или 3096 для S удалось

провести вариант анализа по сравнению с данными 1000 геномов людей.

Результат PCA анализа на картинке внизу представляет из себя наложение двух

картинок для M и W посчитанных по отдельности, так как общих вариантов между

M и W слишком мало, чтобы оценить дистанции между M и W.

Как видно, нет совпадения ни с одной группой генов, также они отличаются д руг от друга.

 Но нужно иметь в виду, что мы использовали кодирующие последовательности под отбором, а рекомендуется использовать варианты находящиеся под нейтральным отбором

Тем не менее, результат PCA хорошо согласуется с ручной проверкой вариантов,

показавшей, что данные находятся в нереференсной гомозиготе, что опять

говорит о том, что образы находятся далеко от генома современного человека.

Заключение

К сожалению, мы были ограничены только двумя образцами, обычно в такого типа

анализах используется больше, хотя бы 3-10 хоть как-то родственных. Поэтому

необходимо продолжение исследований с большим количеством образцов.

В то же время можно с большой вероятностью заключить, что образцы ДНК

Марии и Вавиты соответствуют человеческим ДНК, но не совпадают с доступными

нам ДНК из базы данных 1000 человек.

137