1. Предмет и задачи биологической химии. Обмен веществ и энергии, иерархическая структурная организация и самовоспроизведение как важнейшие признаки живой материи.
2. Многомолекулярные системы (метаболические цепи, мембранные процессы, системы синтеза биополимеров, молекулярные регуляторные системы) как основные объекты биохимического исследования.
3. Уровни структурной организации клетки. Биохимия как молекулярный уровень изучения явлений жизни. Биохимия и медицина.
4. История изучения белков. Представление о белках как важнейшем классе органических веществ и структурно-функциональном компоненте организма человека.
5. Аминокислоты, входящие в состав белков, их строение и свойства. Пептидная связь. Первичная структура белков.
6. Зависимость биологических свойств белков от первичной структуры. Видовая специфичность первичной структуры белков (инсулины разных животных).
7. Конформация пептидных цепей в белках (вторичная и третичная структуры). Слабые внутримолекулярные взаимодействия в пептидной цепи; дисульфидные связи.
8. Основы функционирования белков. Активный центр белков и его специфическое взаимодействие с лигандом как основа биологической функции всех белков. Комплементарность взаимодействия молекул белка с лигандом. Обратимость связывания.
9. Доменная структура и её роль в функционировании белков.
10. Четвертичная структура белков. Особенности строения и функционирования олигомерных белков на примере гемсодержащего белка – гемоглобина.
11. Лабильность пространственной структуры белков и их денатурация. Факторы, вызывающие денатурацию.
12. Шапероны – класс защитных белков, их роль.
13. Многообразие белков. Глобулярные и фибрилярные белки, простые и сложные. Классификация белков по их биологическим функциям и по семействам (сериновые протеазы, иммуноглобулины).
14. Иммуноглобулины, особенности строения, избирательность взаимодействия с антигеном. Многообразие антигенсвязывающих участков Н- и L-цепей. Классы иммуноглобулинов, особенности строения и функционирования.
15. Физико-химические свойства белков. Молекулярный вес, размеры и форма, гидратация, растворимость, ионизация.
16. Устойчивость белковых молекул в растворе, факторы ее определяющие
17. Методы выделения индивидуальных белков: осаждение солями и органическими растворителями, гель-фильтрация, электрофорез, ионообменная и аффинная хроматография.
18. Методы количественного измерения белков. Индивидуальные особенности белкового состава органов. Изменения белкового состава органов в онтогенезе и при болезнях.
19. История открытия и изучения ферментов. Свойства ферментов как катализаторов.
20. Особенности ферментативного катализа. Специфичность действия ферментов. Зависимость скорости ферментативных реакций от температуры, рН, концентрации фермента и субстрата.
21. Классификация и номенклатура ферментов. Изоферменты. Единицы измерения активности и количества ферментов.
22. Кофакторы ферментов: ионы металлов и коферменты. Классификация коферментов. Коферментные функции витаминов (на примере витаминов В6, РР, В2).
23. Ингибиторы ферментов. Обратимое и необратимое ингибирование. Конкурентное ингибирование. Лекарственные препараты как ингибиторы ферментов.
24. Регуляция действия ферментов, типы. Регуляция количества и активности ферментов.
25. Аллостерическая регуляция активности ферментов, аллостерические ингибиторы и активаторы. Каталитический и регуляторный центры.
26. Четвертичная структура аллостерических ферментов и кооперативные изменения конформации протомеров фермента.
27. Ковалентная модификация ферментов как способ регуляции активности. Регуляция путем фосфорилирования и дефосфорилирования. Участие ферментов в проведении гормонального сигнала в клетку.
28. Различия ферментного состава органов и тканей. Органоспецифические ферменты. Изменение ферментов в процессе онтогенеза.
29. Изменение активности ферментов при болезнях. Энзимопатии: наследственные и вторичные. Происхождение ферментов крови и значение их определения при болезнях.
30. Применение ферментов для лечения болезней (энзимотерапия). Применение ферментов как аналитических реагентов при лабораторной диагностике (определении глюкозы, мочевой кислоты и т.д.). Понятие об иммобилизованных ферментах, их значение.
31. Обмен веществ, этапы: питание, транспорт, метаболизм, выделение продуктов метаболизма. Органические и минеральные компоненты пищи. Понятие об основных и минорных компонентах пищи.
32. Основные пищевые вещества: углеводы, жиры, белки, суточная потребность, переваривание; частичная взаимозаменяемость при питании.
33. Незаменимые компоненты основных пищевых веществ. Незаменимые аминокислоты; пищевая ценность различных пищевых белков. Линолевая кислота – незаменимая жирная кислота.
34. История открытия и изучения витаминов. Классификация витаминов. Функции витаминов.
35. Алиментарные и вторичные авитаминозы и гиповитаминозы. Гипервитаминозы. Примеры.
36. Минеральные вещества пищи, их значение. Региональные патологии, связанные с недостаточностью микроэлементов в пище и воде (примеры).
37. Понятие о метаболизме и метаболических путях. Ферменты и метаболизм. Способы регуляции метаболизма. Основные конечные продукты метаболизма у человека.
38. Эндэргонические и экзэргонические реакции в живой клетке. Макроэргические соединения. Представители.
39. Дегидрирование субстрата и окисление водорода (образование Н2О) как источник энергии для синтеза АТФ (дыхательная цепь).
40. Строение митохондрий и структурная организация дыхательной цепи. Трансмембранный электрохимический потенциал.
41. Окислительное фосфорилирование, коэффициент Р/О. Разобщение тканевого дыхания и окислительного фосфорилирования.
42. Регуляция цепи переноса электронов (дыхательный контроль). Терморегуляторная функция тканевого дыхания.
43. Нарушения энергетического обмена: гипоэнергетические состояния как результат гипоксии, гипо-, авитаминозов и других причин.
44. Образование токсических форм кислорода, механизм их повреждающего действия на клетки. Механизмы устранения токсичных форм кислорода. Антиоксидантная система.
45. Катаболизм основных пищевых веществ – углеводов, жиров, белков, этапы (схема). Понятие о специфических и общих путях катаболизма.
46. Окислительное декарбоксилирование пировиноградной кислоты. Последовательность реакций. Строение пируватдегидрогеназного комплекса, энергетический выход, регуляция.
47. Цикл лимонной кислоты: последовательность реакций и характеристика ферментов. Связь между общими путями катаболизма и цепью переноса электронов и протонов.
48. Механизмы регуляции цитратного цикла. Анаболические функции цикла лимонной кислоты. Реакции, пополняющие цитратный цикл.
49. Основные углеводы животных, их содержание в тканях, биологическая роль. Основные углеводы пищи. Переваривание углеводов.
50. Глюкоза как важнейший метаболит углеводного обмена. Общая схема источников и путей расходования глюкозы в организме.
51. Анаэробный распад глюкозы (анаэробный гликолиз). Гликолитическая оксидоредукция, пируват как акцептор водорода. Субстратное фосфорилирование. Распространение и физиологическое значение этого пути распада глюкозы.
52. Биосинтез глюкозы (глюконеогенез) из аминокислот, глицерина и молочной кислоты. Взаимосвязь гликолиза в мышцах и глюконеогенеза в печени (цикл Кори).
53. Аэробный дихотомический распад – основной путь катаболизма глюкозы у человека и других аэробных организмов. Этапы, последовательность реакций до образования пирувата (аэробный гликолиз). Энергетический выход дихотомического аэробного распада, регуляция процесса.
54. Распространение и физиологическое значение аэробного распада глюкозы. Использование глюкозы для синтеза жиров в печени и в жировой ткани.
55. Представление о пентозофосфатном пути превращений глюкозы. Окислительные реакции (до стадии рибулозо-5-фосфата). Распространение и суммарные результаты этого пути (образование пентоз, НАДФН и энергетика).
56. Особенности обмена глюкозы в разных органах и клетках: эритроциты, мозг, мышцы, жировая ткань.
57. Свойства и распространение гликогена как резервного полисахарида. Биосинтез гликогена в печени и в мышцах.
58. Пути распада гликогена в печени и мышцах. Мобилизация гликогена, особенности процесса.
59. Представление о строении и функциях углеводной части гликолипидов и гликопротеинов. Сиаловые кислоты.
60. Наследственные нарушения обмена моносахаридов: галактоземия, непереносимость фруктозы, причины, биохимические нарушения и проявления.
61. Наследственные нарушения обмена дисахаридов: понятие о мальабсорбции. Гликогенозы и агликогенозы.
62. Важнейшие липиды тканей человека. Резервные липиды (жиры) и липиды мембран (структурные липиды). Жирные кислоты липидов тканей человека, особенности.
63. Незаменимые факторы питания липидной природы. Эссенциальные жирные кислоты: w-3- и w-6-кислоты как предшественники синтеза эйкозаноидов.
64. Пищевые жиры и их переваривание. Всасывание продуктов переваривания. Нарушение переваривания и всасывания. Ресинтез триацилглицеринов в стенке кишечника.
65. Образование хиломикронов и транспорт жиров. Роль апопротеинов в составе хиломикронов. Липопротеинлипаза.
66. Транспорт жирных кислот в клетку. Химизм реакций b-окисления жирных кислот, энергетический итог, значение процесса.
67. Биосинтез жирных кислот, химизм, энергетика, регуляция метаболизма жирных кислот.
68. Биосинтез ненасыщенных жирных кислот.
69. Ацетил-КоА, пути образования, судьба в организме.
70. Биосинтез и использование кетоновых тел в качестве источников энергии.
71. Биосинтез жиров в печени из углеводов. Структура и состав транспортных липопротеинов крови.
72. Депонирование и мобилизация жиров в жировой ткани. Регуляция синтеза и мобилизации жиров. Роль инсулина, глюкагона и адреналина в этих процессах.
73. Основные фосфолипиды и гликолипиды тканей человека (глицерофосфолипиды, сфингофосфолипиды, глицеролгликолипиды, сфигогликолипиды), роль этих соединений в процессах жизнедеятельности. Представление о биосинтезе и катаболизме этих соединений.
74. Фосфолипиды, строение, основные представители, свойства, биологическая роль.
75. Катаболизм и биосинтез глицеролфосфолипидов в тканях.
76. Основные гликолипиды тканей человека, строение, биологическая роль.
77. Общие представления о биосинтезе и катаболизме сфингогликолипидов.
78. Нарушение обмена нейтрального жира (ожирение), фосфолипидов и гликолипидов. Сфинголипидозы.
79. Строение и биологические функции эйкозаноидов. Биосинтез простагландинов и лейкотриенов.
80. Холестерин как предшественник ряда других стероидов. Представление о биосинтезе холестерина. Написать ход реакций до образования мевалоновой кислоты. Роль гидроксиметилглутарил-КоА-редуктазы.
81. Синтез жёлчных кислот из холестерина. Конъюгация жёлчных кислот, первичные и вторичные желчные кислоты. Выведение жёлчных кислот и холестерина из организма.
82. Липопротеины как транспортная форма липидов. Типы, состав и строение липопротеинов крови, взаимопревращения липопротеинов.
83. ЛПНП и ЛПВП – транспортные формы холестерина в крови, образование, роль в обмене холестерина. Гиперхолестеринемия. Биохимические основы развития атеросклероза.
84. Механизм возникновения жёлчно-каменной болезни (холестериновые камни). Применение хенодезоксихолевой кислоты для лечения жёлчно-каменной болезни.
85. Общая схема источников и путей расходования аминокислот в тканях. Динамическое состояние белков в организме.
86. Переваривание белков (схема гидролитического расщепления). Общая характеристика протеолитических ферментов пищеварительного канала.
87. Протеиназы желудочно-кишечного тракта; проферменты протеиназ и механизмы их превращения в ферменты. Значение процесса.
88. Субстратная специфичность протеиназ. Экзопептидазы и эндопептидазы.
89. Диагностическое значение биохимического анализа желудочного и дуоденального сока. Краткая характеристика состава этих соков.
90. Протеиназы поджелудочной железы и панкреатиты. Применение ингибиторов протеиназ для лечения панкреатитов.
91. Катаболизм белков в тканях. Транспорт аминокислот в клетку, пути превращений аминокислот в клетках.
92. Трансаминирование: аминотрансферазы; коферментная функция витамина В6. Специфичность аминотрансфераз.
93. Аминокислоты, участвующие в трансаминировании; особая роль глутаминовой кислоты. Биологическое значение реакций трансаминирования.
94. Окислительное дезаминирование аминокислот; глутаматдегидрогеназа. Непрямое дезаминирование аминокислот. Биологическое значение.
95. Основные источники аммиака в организме, обезвреживание аммиака в месте образования, транспортные формы аммиака.
96. Роль глутамина в обезвреживании и транспорте аммиака. Глутамин как донор амидной группы при синтезе ряда соединений. Глутаминаза почек; образование и выведение солей аммония.
97. Синтез мочевины, химизм, энергетика процесса. Связь орнитинового цикла с ЦТК. Происхождение атомов азота мочевины. Нарушения синтеза и выведения мочевины. Гипераммонемии.
98. Трансметилирование. Метионин и S-аденозилметионин. Синтез креатина, адреналина и фосфатидилхолинов.
99. Метилирование ДНК. Представление о метилировании чужеродных и лекарственных соединений.
100. Источники и образование одноуглеродных групп. Тетрагидрофолиевая кислота и цианкобаламин и их роль в процессах трансметилирования.
101. Обмен фенилаланина и тирозина в норме. Фенилкетонурия; биохимический дефект, проявление болезни, методы предупреждения, диагностика и лечение.
102. Алкаптонурия и альбинизм: биохимические дефекты, при которых они развиваются. Нарушение синтеза дофамина, паркинсонизм.
103. Декарбоксилирование аминокислот. Структура биогенных аминов (гистамин, серотонин, g-аминомасляная кислота, катехоламины). Функции биогенных аминов.
104. Дезаминирование биогеных аминов (как реакции обезвреживания этих соединений).
105. Обмен безазотистого остатка аминокислот. Гликогенные и кетогенные аминокислоты. Синтез глюкозы из аминокислот. Синтез аминокислот из глюкозы.
106. Нуклеиновые кислоты, химический состав, строение. Первичная структура ДНК и РНК, связи, формирующие первичную структуру.
107. Вторичная и третичная структура ДНК. Денатурация, ренативация ДНК. Гибридизация, видовые различия первичной структуры ДНК.
108. РНК, химический состав, уровни структурной организации. Типы РНК, функции. Строение рибосомы.
109. Строение хроматина и хромосомы.
110. Распад нуклеиновых кислот. Нуклеазы пищеварительного тракта и тканей. Распад пуриновых нуклеотидов, образование мочевой кислоты.
111. Представление о биосинтезе пуриновых нуклеотидов; начальные стадии биосинтеза (от рибозо-5-фосфата до 5-фосфорибозиламина). Инозиновая кислота как предшественник адениловой и гуаниловой кислот.
112. Представление о распаде и биосинтезе пиримидиновых нуклеотидов.
113. Биосинтез дезоксирибонуклеотидов. Применение ингибиторов синтеза нуклеиновых кислот для лечения злокачественных опухолей.
114. Нарушения обмена нуклеотидов. Подагра; применение аллопуринола для лечения подагры. Ксантинурия. Оротацидурия.
115. Биосинтез ДНК, субстраты, источники энергии, матрица, ферменты. Понятие о репликативном комплексе. Этапы репликации.
116. Синтез ДНК и фазы клеточного деления. Роль циклинов и циклинзависимых протеинкиназ в продвижении клетки по клеточному циклу.
117. Повреждение и репарация ДНК. Ферменты ДНК-репарирующего комплекса.
118. Биосинтез РНК. РНК полимеразы. Понятие о мозаичной структуре генов, первичном транскрипте, посттранскрипционном процессинге.
119. Биологический код, понятия, свойства кода, коллинеарность, сигналы терминации.
120. Роль транспортных РНК в биосинтезе белков. Биосинтез аминоацил-т-РНК. Субстратная специфичность аминоацил-т-РНК-синтетаз.
121. Последовательность событий на рибосоме при сборке полипептидной цепи. Функционирование полирибосом. Посттрансляционный процессинг белков.
122. Адаптивная регуляция генов у про- и эукариотов. Теория оперона. Функционирование оперонов. Роль энхансеров и сайленсеров в регуляции биосинтеза белка.
123. Понятие о клеточной дифференцировке. Изменение белкового состава клеток при дифференцировке (на примере белкового состава полипептидных цепей гемоглобина).
124. Молекулярные механизмы генетической изменчивости. Молекулярные мутации: типы, частота, значение.
125. Рекомбинация как источник генетической изменчивости. Механизмы увеличения числа и разнообразия генов в геноме.
126. Генетическая гетерогенность. Полиморфизм белков в популяции человека (варианты гемоглобина, гликозилтрансферазы, группоспецифических веществ и др).
127. Биохимические основы возникновения и проявления наследственных болезней (разнообразие, распространение).
128. Основные системы межклеточной коммуникации: эндокринная, паракринная, аутокринная регуляция. Роль гормонов в системе регуляции метаболизма. Клетки-мишени и клеточные рецепторы гормонов.
129. Классификация гормонов по химическому строению и биологическим функциям
130. Механизмы передачи гормональных сигналов в клетки.
131. Строение, синтез и метаболизм йодтиронинов. Влияние на обмен веществ. Изменение метаболизма при гипо- и гипертиреозе. Причины и проявление эндемического зоба.
132. Регуляция энергетического метаболизма, роль инсулина и контринсулярных гормонов в обеспечении гомеостаза.
133. Изменения метаболизма при сахарном диабете. Патогенез основных симптомов сахарного диабета.
134. Патогенез поздних осложнений сахарного диабета (макро- и микроангиопатии, нефропатия, ретинопатия, катаракта). Диабетическая кома (механизм развития).
135. Регуляция водно-солевого обмена. Строение и функции альдостерона и вазопрессина.
136. Система ренин-ангиотензин-альдостерон. Биохимические механизмы возникновения почечной гипертонии, отеков, дегидратации.
137. Кислотно-основное состояние организма, основные показатели, механизм поддержания.
138. Нарушения кислотно-основного состояния. Типы нарушений, причины и механизмы возникновения ацидоза и алкалоза.
139. Роль гормонов в регуляции обмена кальция и фосфатов (паратгормон, кальцитонин). Причины и проявление гипо- и гиперпаратироидизма.
140. Строение, биосинтез и механизм действия кальцитриола. Причины и проявление рахита.
141. Строение и секреция кортикостероидов. Изменения катаболизма при гипо- и гиперкортицизме.
142. Регуляция синтеза и секреции гормонов по принципу обратной связи.
143. Половые гормоны: строение, влияние на обмен веществ и функции половых желез, матки и молочных желез.
144. Гормон роста, строение, биологическая роль, нарушения гормональной функции.
145. Метаболизм эндогенных и чужеродных токсических веществ: реакции микросомального окисления и реакции конъюгации с глутатионом, глюкуроновой кислотой, серной кислотой. Метилирование.
146. Металлотионеин и обезвреживание ионов тяжелых металлов. Белки теплового шока.
147. Токсичность кислорода, активные формы кислорода (супероксид анион, перекись водорода, гидроксильный радикал).
148. Повреждение мембран в результате перекисного окисления липидов. Механизмы защиты от токсического действия кислорода: неферментативные (витамины Е, С, глутатион и др.) и ферментативные (супероксиддисмутаза, каталаза, глутатионпероксидаза) компоненты антиоксидантной системы.
149. Биотрансформация лекарственных веществ. Влияние лекарств на ферменты, участвующие в обезвреживании ксенобиотиков.
150. Основы химического канцерогенеза. Представление о некоторых химических канцерогенах.
151. Особенности развития, строения и метаболизма эритроцитов.
152. Транспорт кислорода и диоксида углерода кровью. Схема переноса газов кровью. Гемоглобин плода (НbF) и его физиологическое значение.
153. Полиморфные формы гемоглобинов человека. Гемоглобинопатии. Анемические гипоксии.
154. Биосинтез гема и его регуляция. Нарушения синтеза гема. Порфирии.
155. Распад гема. Обезвреживание билирубина. Нарушения обмена билирубина – желтухи: гемолитическая, обтурационная, печеночно-клеточная. Желтуха новорожденных.
156. Диагностическое значение определения билирубина и других желчных пигментов в крови и моче.
157. Обмен железа: всасывание, транспорт кровью, депонирование. Нарушение обмена железа: железодефицитная анемия, гемохроматоз.
158. Основные белковые фракции плазмы крови и их функции. Значение их определения для диагностики заболеваний. Энзимодиагностика.
159. Калликреин-кининовая система, представители, биологическая роль кининов.
160. Свёртывающая система крови. Внутренний и внешний пути свёртывания и их компоненты.Этапы образования фибринового тромба.
161. Принципы образования и последовательность фукционирования ферментных комплексов прокоагулянтного пути. Роль витамина К в свёртывании крови.
162. Основные механизмы фибринолиза. Активаторы плазминогена как тромболитические средства.
163. Антисвёртывающая система. Основные антикоагулянты крови: протеин С, антитромбин III, α2 -макроглобулин, антиконвертин. Гемофилии.
164. Основные мембраны клетки и их функции. Общие свойства мембран: жидкостность, поперечная асимметрия, избирательная проницаемость.
165. Липидный состав мембран (фосфолипиды, гликолипиды, холестерин). Роль липидов в формировании липидногобислоя.
166. Белки мембран – интегральные, поверхностные, «заякоренные». Значение посттрансляционных модификаций в образовании функциональных мембранных белков.
167. Механизмы переноса веществ через мембраны: простая диффузия, первично-активный транспорт (Na+-К+-АТФаза, Ca2+-АТФаза), пассивный симпорт и антипорт, вторично-активный транспорт.
168. Трансмембранная передача сигнала. Участие мембран в активации внутриклеточных регуляторных систем – аденилатциклазной и инозитолфосфатной – в передаче гормонального сигнала.
169. Коллаген: особенности аминокислотного состава, первичной и пространственной структуры. Роль аскорбиновой кислоты в гидоксилировании пролина и лизина.
170. Особенности биосинтеза и созревания коллагена. Проявления недостаточности витамина С.
171. Особенности строения и функции эластина.
172. Гликозамингликаны и протеогликаны. Строение и функции. Роль гиалуроновой кислоты в организации межклеточного матрикса.
173. Адгезивные белки межклеточного матрикса: фибронектин и ламинин, их строение и функции. Роль этих белков в межклеточных взаимодействиях и развитии опухолей.
174. Структурная организация межклеточного матрикса. Изменения соединительной ткани при старении, коллагенозах. Роль коллагеназы при заживлении ран. Оксипролинурия.
175. Важнейшие белки миофибрилл: миозин, актин, актомиозин, тропомиозин, тропонин, актинин.
176. Биохимические механизмы мышечного сокращения и расслабления. Роль градиента одновалентных ионов и ионов кальция в регуляции мышечного сокращения и расслабления.
177. Саркоплазматические белки: миоглобин, его строение и функции. Экстрактивные вещества мышц.
178. Особенности энергетического обмена в мышцах. Креатинфосфат.
179. Биохимические изменения при мышечных дистрофиях и денервации мышц. Креатинурия.
180. Химический состав нервной ткани. Миелиновые мембраны: особенности состава и структуры.
181. Энергетический обмен в нервной ткани. Значение аэробного распада глюкозы.
182. Биохимия возникновения и проведения нервного импульса. Молекулярные механизмы синаптической передачи.
183. Медиаторы: ацетилхолин, катехоламины, серотонин, g-аминомаслянная кислота, глутаминовая кислота, глицин, гистамин.
184. Физиологически активные пептиды мозга.