Аскомицет спорынья содержит высокотоксичные алкалоиды. Употребление в пищу муки, засоренной спорыньей, вызывает у человека тяжелое отравление – эрготизм или «антонов огонь» (длительные судороги рук и ног, боли в желудке). Вместе с тем, алкалоиды спорыньи широко применяются в медицине, особенно в акушерско-гинекологической практике, где они известны с начала XV века.
Другая группа грибных ядов - трихотецены. Они подавляют синтез белка. Микотоксины, выделяемые грибами из рода альтернария, вызвали весной 1944 г. вспышку токсической алейкии в СССР, что было связано с употреблением в пищу зёрен злаков, перезимовавших в поле и заражённых грибами.
Многие ядовитые грибы принадлежат к семейству мухоморовых. Из этого рода бледная поганка и мухомор вонючий, которые ядовиты смертельно. Токсины, содержащиеся в них – фаллоидин и аманитин, действуют через 10 - 12 часов, когда помочь уже нельзя. Многие яды древности и средних веков изготавливали их этих грибов.
С XVI века известен культ священных мексиканских грибов, относящихся к роду псилоцибе, их опьяняющее и наркотическое действие. Грибы вызывают галлюцинации, весёлость, возбуждение, фантастические видения. Из них синтезировано вещество псилоцибин, сейчас применяемое в психотерапии.