Переход большой системы от линейной структуры к нелинейной (рис.2) сопровождается выделением отдельных самостоятельных малых систем, различающихся своими функциями. Здесь выделяются измерительные части, пользовательские части ответственные за хранение и преобразование информации. Но при этом соблюдается обязательное свойство больших систем – фрактальность: каждая часть в миниатюре повторяет целое. Иными словами, каждая самостоятельная малая система является полноценной, имея своих пользователей (персонал какого-либо организационного подразделения), администраторов, свой сервер и специфическое программное обеспечение (ПО), свои интерфейсы и витрины исходных и выходных данных.
Рис.2 Структура "Орбиты" нелинейной MES-системы
В качестве малых систем выделяются функциональные модули (ФМ), измерительные и аналитические, и автономные пользовательские подсистемы (АС).