Эндонуклеазы. FEN-1

В ходе процессинга фрагментов Оказаки, равно как и в процессе репарации ДНК, в качестве промежуточных продуктов реакции возникают структуры ДНК, имеющие свисающий 5'-конец (флэп). Главная причина появления таких структур - активность Ро1δ, обеспечивающая синтез с вытеснением цепи ("strand-displasment”). Основным ферментом, выщепляющим флэп-структуры, является флэп-эндонуклеаза-1 (FEN-1). Предполагается, что при выщеплении таких структур FEN-1 взаимодействует с различными белками, в том числе с RРА и PCNA. Предполагалось, что RРА будет связываться с коротким флэпом в глобулярной форме, в то время как относительно длинный флэп позволяет реализовать размещение RРА в вытянутой конформации и обеспечить эффективное связывание с ДНК за счет всех его ДНК-связывающих доменов. Количественная оценка связывания RРА и FEN-1 с ДНК отчетливо показала конкуренцию RРА с FEN-1 за флэп-структуры протяженного размера, что может указывать на возможность ингибирования активности FEN-1 RРА.