Самой распространенной причиной возникновения пигментации на постоянных зубах после их прорезывания является подповерхностная деминерализация при начальном кариесе и на ранних этапах кислотного некроза.
Пигментация эмали и дентина может развиваться как результат проникновения красителей в прижизненные трещины зуба.
Окрашивание целой группы зубов может быть связано с действием неблагоприятных производственных и экологических факторов. Пары брома и йода окрашивают пришеечные области зубов в желтоватый цвет. Коричнево-черный налет на зубах появляется у лиц, занятых обработкой металлов (марганца, железа, никеля). Хроническое отравление ртутью, сулемой, свинцом приводит к диффузному окрашиванию зубов различной интенсивности — от серого до черного или от желтого до коричневого цвета.
Особо следует остановиться на пигментации зубов у курильщиков. Наиболее характерно образование темно-коричневого, почти черного налета вдоль шеек зубов, а также на тех поверхностях, которые не участвуют в жевании и плохо очищаются. Образованию «налета курильщика» способствует плохая гигиена полости рта. Может отмечаться также пигментация по периметру пломб, вкладок, вдоль трещин зуба.
Сходная окраска, которую можно отнести к воздействию пищевых пигментов, однако менее интенсивная и менее стойкая, чем от воздействия никотина, наблюдается у любителей кофе и крепкого чая. Содержание в питьевой воде железа может вызвать устойчивую синеватую окраску зубов.
Возрастные изменения окраски эмали и дентина, являющиеся одним из внешних признаков старения зуба, связаны с рядом причин, среди которых следует отметить убыль эмали, изменения в пульпе, а именно образование значительного количества вторичного дентина, а также отложение в зубах липохромов.
Интенсивное прокрашивание тканей зуба при заболеваниях пародонта, особенно в пришеечной области, вызвано изменением проницаемости эмали под влиянием зубного налета