Таблица 1 «СВОЙСТВА РАДИКАЛОВ АМИНОКИСЛОТ»
1. Определение полярности: группа полярна, если заряд в ней распределен ассиметрично
2. Признак полярности: заряд распределен ассиметрично, если группа содержит электрофильные элементы – O, N, S, P
3. Связь полярности с гидрофильностью: полярные группы гидрофильны (вокруг них ориентированы молекулы воды), неполярные гидрофобны (стремятся уйти от водной фазы)
*радикалы мет и три практически неполярны
** радикал Гис способен к слабой ионизации
Классификация радикалов АК по функциональным группам | Соответствующие АК | Полярность радикалов | Какую связь образует радикал в белке | Ориентация радикала в белковой глобуле |
1) АК без радикала | Гли | Неполярные (гидрофобные) | гидрофобную | Преимущественно внутри глобулы |
2) углеводородные радикалы | Ала, вал, лей, илей, фен, про | |||
3) серусодержащие радикалы | цис | Полярные незаряженные (гидрофильные) | дисульфидную | Преимущественно кнаружи (к водной фазе) |
мет* | водородную | |||
4) радикалы с группой -ОН, недиссоциирующие | сер, тре, тир, оксипролин | |||
5) радикалы с атомами азота, недиссоциирующие | 1) Амиды МАДК (асн, глн) 2) гетероциклические АК (три*,гис**) | |||
6) диссоциирующие (ионные) радикалы | 1) МАДК (асн, глн) 2) ДАМК (арг, лиз, оксилизин) | Полярные заряженные (гидрофильные) | ионную |
|
|