Общие.
· Плазмидная ДНК, выделенная этим методом, не имеет особого загрязнения геномной ДНК и РНК, но концентрация ее очень мала. Тем не менее, ее вполне достаточно для химической трансформации E.coli. Если трансформировать 5µl выделенной плазмиды, то вырастает обычно около сотни колоний.
· Плазмида также годится для проведения PCR.
По пунктам.
п. 1.
· Мы обычно растим дрожжи в SD среде с необходимым набором аминокислот. Если необходимо, с добавлением антибиотиков. В богатой среде YPD можно растить только те плазмиды, которые достаточно стабильны и не теряются в процессе роста дрожжей.
п. 4.
· Литиказа (Sigma, #L4025) разрушает клеточную стенку дрожжей.
п. 13.
· Мы используем стекловолоконные колонки фирмы Amersham (GFX PCR DNA and Gel Band Purification Kit, #27-9602-01). Можно также использовать кит фирмы Qiagen или любой аналогичный.
п. 14.
· Пробирка берется такая, что бы уровень жидкости после центрифугирования в пунктах 15, 16,17 не касался нижнего края колонки. Можно использовать 2ml пробирки с завинчивающейся крышкой или пробирки из кита.
п. 15,16,17.
· После каждого пункта, удалять жидкость, прошедшую через колонку.
п. 20.
· Элюат - это то, что сошло с колонки.