Нуклеотиды являются составной частью нуклеиновых кислот. Входят в состав некоторых коферментов (в частности АМФ), могут образовать ди- и трифосфорные производные, вещества, богатые энергией. Например, из АМФ могут образоваться АДФ, АТФ. Из других НМФ образуются соответствующие НДФ и НТФ.