(26
вокруг молекул фермента стерические ограничения, т. е- как бы экранирует их от внешнего раствора. Это приводит к существенному ограничению диффузии молекул другихт не связанных с носителем ферментов, в частности протеаэ, фосфорилаз, фосфата з. Поэтому для иммобилизованных ферментов практически сведены на нет такие инактивационные процессы, как протеолизт микробное заражение и фосфоршшрование.
Иммобилизованные белки стабильнее нативных по отношению к инактивации в потоке. Причина заключается в том, что носитель механически защищает молекулы ферментов от деформации в потоке, выполняя роль своеобразного демпфера.
В последние годы активно развиваются методы иммобилизации, позволяющие ковалентно пришивать молекулу кофактора в районе активного центра фермента или совместно иммобилизовать молекулы кофактора н фермента на одном носителе в непосредственной близости друг от друга. С помощью таких методических приемов становится возможным подавить таком ннак-тивационный механизм, как десорбция кофактора из активного центра фермента.
|
|
Наиболее сложная задача — затормозить химические изменения в белке, приводящие к инактивации. Однако и в этой области имеются положительные примеры использования иммобилизации.
В тех случаях, когда инактивация происходит под действием пероксида водорода или супероксидных радикалов, хорошо за-рекомендовал себя следующий прием. Подвергающийся инактивации белок иммобилизуют совместно с каталазой или супероксид-дисмутазой — ферментами, катализирующими разложение, соответственно, НэОа и OjT
Как уже говорилось, некоторые ферменты инактивируются вследствие окисления кислородом воздуха высокореакштнно-способных функциональных групп их активного центра и в первую очередь SH-групп. Такую инактивацию также удается подавить методами иммобилизации. Для этого фермент иммобилизуют в полиэлектролитной матрице, обладающей способностью «высаливать» кислород. В результате фермент экранирован от контакта с инактиватором и стабильность его по отношению к окислению становится существенно выше, чем у неиммоби-лизованного,
Кроме того, можно создать условия для конкуренции за вещество-инактиватор. Например* многие ферменты, имеющие SH-группы, необходимые для катализа, ннактивируются в результате их «отравления» катионами тяжелых металлов по механизму образования меркаптидов. Иммобилизуя такой фермент с другим белком с высоким содержанием реакцией неспособных SH-групп или пришивая к матрице носителя низкомолекулярные тнолы, добиваются того, что основная часть катионов металлов расходуется не на «отравление» фермента, а на модификацию SH-rpynn «несущественного» белка или тиола.
|
|
§ 4. Подавление с помощью иммобилизации первичных обратимых стадий денатурации и диссоциации матнвных белков
Как уже отмечалось, практически любой инактивационный процесс начинается с обратимой стадии [N^TD на схеме (1)]. Ее молекулярный механизм сводится либо к обратимому конфор-мацнонному изменению (обратимая денатурация), либо, в случае олигомерных белков, к обратимой диссоциации на субъединицы. В этом случае стабилизация ферментов состоит в том, чтобы подавить первую стадию.
На основе подобных представлений разработан ряд общих принципов, следуя которым можно в сотни и тысячи раз замедлить необратимую инактивацию большого числа различающихся по структуре и функции ферментов. В результате стало возможным проводить целенаправленный поиск конкретных путей стабилизации как мономерных белков, так и ферментов с четвертичной структурой, используемых в биотехнологии.
Наибольшие успехи в стабилизации ферментов связаны с применением метода иммобилизации. В общем случае можно указать по крайней мере три причины изменения стабильности в результате иммобилизации: 1) изменение конформации иммобилизованного фермента по сравнению с нативной структурой; 2) изменение микроокружения ферментной молекулы; 3) ужест-ченне нативной конформации белковой глобулы. Первые два фактора, по-видимому, нельзя положить в основу разработки общих методов стабилизации ферментов. Дело в томт что вопрос о связи стабильности белков с изменением их конформации и микроокружения является малоизученным. Более того, такая связь (даже если ее удастся установить) индивидуальна для каждого фермента. Поэтому для целенаправленной стабилизации ферментов гораздо более перспективным представляется третий путь — ужестчение (закрепление) нативной конформации фермента с целью воспрепятствовать ее разворачиванию. Следует отметить, что этот подход (увеличение жесткости белков) широко используется природой при создании стабильных белков термофильных микроорганизмов, живущих при повышенных температурах (50°С и выше).
Многоточечное не ко валентное взаимодействие фермента с носителем. В принципе белковые молекулы могут связываться с теми носителями, на поверхности которых имеются заряженные, гидрофобные, полярные группы, за счет относительно слабых электростатических и гидрофобных взаимодействий, водородных связей. Однако, поскольку эти связи слабые, они прак тически не обрузуются в разбавленных растворах полимерных носителей. Дело в том, что большие потери энтропии, происходящие при образовании комплекса белок — носитель вследствие «замораживания» поступательного и вращательного движения моле-