Задачі для самостійного розв’язання

1. Eco RI вносить один розрив в молекулу ДНК. Скільки утвориться фрагментів, якщо це: 1) лінійна молекула; 2) кільцева молекула.

2. Скільки утвориться фрагментів під дією трьох рестриктаз, які вносять по одному розриву в: 1) лінійну молекулу; 2) кільцеву молекулу. Вкажіть можливі варіанти.

3. Яка з двох рестриктаз, Mbo I чи Mst I, внесе більше розривів в ДНК, яка є випадковою послідовністю нуклеотидів?

4. Яка з двох рестриктаз, Acc I чи Hpa II, внесе більше розривів в ДНК, яка є випадковою послідовністю нуклеотидів? Поясніть.

5. “Липкий кінець”, утворений рестриктазою Bam HI, зливається з “липким кінцем”, утвореним рестриктазою Xho II. Сайт впізнавання якої рестриктази залишиться (утвориться) в результаті реакції?

6. “Липкий кінець”, утворений рестриктазою Xho I, зливається з “липким кінцем”, утвореним рестриктазою Ava I. Сайт впізнавання якої рестриктази залишиться (утвориться) в результаті реакції?

7. Задайте послідовність нуклеотидів, яка була би полілінкером для таких рестриктаз:

Ava I; Bam HI; Hpa II.

8. Задайте послідовність нуклеотидів, яка була би полілінкером для таких рестриктаз:

Hae III; Hind III; Hind II.

9. Використовуючи задану послідовність нуклеотидів, створіть сайт впізнавання для таких рестриктаз:

CCGG Hpa II, Xma I, Ava I, Nae I.

Покажіть направлення розщеплення. Яка з рестриктаз впізнає декілька

послідовностей і які саме?

10. Використовуючи задану послідовність нуклеотидів, створіть сайт рестрикції для таких рестриктаз:

TCGA Tog I, Cla II, Pvu I.

Покажіть направлення розщеплення. Яка з рестриктаз впізнає декілька

послідовностей і які саме?

11. Які фрагменти утворяться при гідролізі молекули ДНК довжиною 900 п.н. рестриктазою, якщо вона вносить один розрив на 150 п.н. Вкажіть можливі варіанти.

12. При обробці кільцевої молекули ДНК віруса SV40 окремими рестриктазами та їх сумішшю одержують такі фрагменти (розміри в т.п.н.):

Eco RI – 5,2; Hind II – 2,4; 2,3; 0,5; Hind IIІ – 3,2; 2,0; Eco RI і Hind II – 2,3; 1,3; 1,1; 0,5; Eco RI і Hind III – 3,2; 1,3; 0,7; Hind II і Hind III – 2,1; 1,8; 0,6; 0,5; 0,2.