1) специальные целевые налоги и сборы, установленные для соответствующих фондов,
2) средства бюджета,
3) прибыль от коммерческой деятельности, осуществляемой фондом, как юридическим лицом,
4) займы и кредиты,
5) добровольные взносы юридических и физических лиц,
6) иные доходы (например, штрафы).
Источники формирования фондов зависят от характера и масштабности задач, для реализации которых они созданы; поэтому источники фондов имеют как постоянный, так и временный характер.
Материальным источником внебюджетных фондов, как и других звеньев финансовой системы, является Национальный доход.
Преобладающая часть фондов создается в процессе перераспределения Национального дохода.
Внебюджетные фонды федерального уровня, как правило, выделяют часть своих средств в распоряжение территориальных органов. Для этого определяется доля налогов, поступающих в федеральные, региональные и местные фонды.
Направления расходования средств внебюджетных фондов определяются назначением (уставом) фондов. Обычно в их названии указывается цель расходования средств.
Внебюджетные фонды могут выступать инвесторами и участниками финансового фондового рынка. Доходы от инвестиций являются дополнительными источниками средств фондов.