Практическая работа №10. Двухфакторный дисперсионный анализ

Структура двухфакторного дисперсионного комплекса. В табл. 10.1. представлена структура двухфакторного дисперсионного комплекса в общем виде. Градации фактора А обычно располагают по строчкам, фактора В – по столбцам таблицы.

Таблица 10.1. Структура двухфакторного дисперсионного комплекса

Градации фактора А

Градации фактора В

Σ х i..

ni ..

1

 

j

 

b

1

х 111

Σ x 11.

n 11.

х 1j1

Σ x 1j.

n 1j.

х 1b1

Σ x 1b.

n 1b.

Σ х i..

ni ..

х 112 х 1j2 х 1b2

i

х i11

Σ x i1.

n i1.

х ij1

Σ x ij.

n ij.

х ib1

Σ x ib.

n ib.

Σ х i..

ni ..

x i12 x ij2 x ib2

a

x a11

Σ x a1.

n a1.

x aj1

Σ x aj.

n aj.

x ab1

Σ x ab.

n ab.

Σ х i..

ni ..

x a12 x aj2 x ab2
Σ x .j.

Σ x .1.

Σ x .j.

Σ x .b.

Σ х i..

ni ..

n .j.

n .1.

n .j.

n .b.

Параметры, входящие в двухфакторный дисперсионный комплекс:

хijk отдельное наблюдение (варианта);

Σ x сумма всех наблюдений по комплексу;

Σ xi .. суммы наблюдений по градациям фактора А;

Σ x . j . суммы наблюдений по градациям фактора В;

Σ xij . суммы наблюдений по сочетаниям градаций фактора А и В;

N   число всех наблюдений по комплексу (объем комплекса);

ni .. число наблюдений по градациям фактора А;

n . j . число наблюдений по градациям фактора В;

nij . число наблюдений по сочетаниям градаций фактора А и В;

общее среднее арифметическое по комплексу;

средние арифметические по градациям фактора А;

средние арифметические по градациям фактора В;

средние арифметические по сочетаниям градаций фактора А и В.

a   число градаций по фактору А

b   число градаций по фактору В

Если число наблюдений по сочетаниям градаций фактора А и В (nij .) константно, то комплекс является равномерным. В случае если  варьирует - комплекс будет неравномерным.

Типы варьирования переменных в двухфакторном дисперсионном комплексе. В анализируемом комплексе различают 5 типов варьирования переменных:

1) общая вариация – варьирование отдельных наблюдений (хijk) вокруг средней по комплексу ();

2) вариация, связанная с влиянием фактора А – варьирование средних по градациям фактора А () вокруг средней по комплексу ();

3) вариация, связанная с влиянием фактора В – варьирование средних по градациям фактора В () вокруг средней по комплексу ();

4) вариация, связанная со взаимодействием факторов А и В – варьирование средних по сочетанию градаций факторов А и В () вокруг средней по комплексу () без учета вариации, связанной с влиянием факторов А и В;

5) случайная вариация отдельных наблюдений () вокруг средних по сочетанию градаций факторов А и В ().

Суммы квадратов отклонений вариант от средней (SS). Поскольку типов вариации переменных в двухфакторном комплексе пять, вычисляются 5 различных SS:

Приведенные формулы используются неравномерного комплекса. Если комплекс равномерный, соответствующие численности (ni .., n.j., nij.) выносятся за знак суммы в виде знаменателя дроби (в числителе – единица) и вычисления значительно упрощаются.

Если суммы отклонений рассчитаны правильно должно выполняться следующее равенство:

Числа степеней свободы (df). Для каждой суммы квадратов отклонений рассчитывается своё число степеней свободы:

где  - среднее число наблюдений по сочетаниям градаций факторов А и В.

Если числа степеней свободы рассчитаны правильно, должно выполняться равенство:

Средние квадраты (ms). Необходимо вычислить 4 средних квадрата:

Критерии Фишера (F). Вычисляются 3 эмпирических значения критерия Фишера:

Для каждого эмпирического значения по таблицам определяются стандартные критерия Фишера на 5% и 1% уровнях значимости (приложения 2.4 и 2.5). Если какое-либо эмпирическое значение F > F 05 и F > F 01, нулевая гипотеза об отсутствии влияния данного фактора (факторов) или взаимодействия факторов отклоняется.

Если F 05 < F < F 01, то на 5% уровне значимости нулевую гипотезу следует отклонить, а на 5% - принять. В этом случае рекомендуется продолжить экспериментальные исследования по изучению влияния данного фактора на изменчивость переменного.

Если F < F 05, то нулевая гипотеза об отсутствии влияния соответствующего фактора принимается.

Структура средних квадратов и вычисление дисперсий. Если влияние фактора или взаимодействия факторов недостоверно соответствующие дисперсии приравниваются к 0. Если доказано достоверное влияние фактора, то необходимо вычислить величину соответствующей дисперсии. В большинстве экспериментов оба фактора имеют фиксированные градации. Рассмотрим структуру средних квадратов и оцениваемые параметры для этой модели дисперсионного анализа (табл. 10.3):

Таблица 10.3. Структура средних квадратов и формулы для вычисления дисперсий в двухфакторном дисперсионном анализе с фиксированными градациями факторов

Структуры средних квадратов Формулы для вычисления дисперсий

После вычисления дисперсий у достоверно влияющих факторов, их взаимодействия и случайной вариации вычисляется общая дисперсия:

Дисперсии необходимы для вычислений долей влияния источников вариации переменного.

Определение доли влияния факторов. Доли влияния источников вариации вычисляют как частные от деления соответствующей дисперсии на общую дисперсию. Обычно доли выражают в процентах:

Вычисление наименьшей существенной разности (НСР). НСР вычисляется для каждого среднего по градациям факторов и их сочетанию. При проведении двухфакторного анализа максимально вычисляется 3 типа НСР. Если источник вариации недостоверно влияет на переменное, то НСР для сравнения соответствующих средних не вычисляется. Для вычисления НСР необходимо установить ошибки средних по следующим формулам:

 (ошибка средних по градациям фактора А)

 (ошибка средних по градациям фактора В)

 (ошибка средних по сочетанию градаций факторов А и В)

Стандартное значение критерия Тьюки (Q 05). Определяется по таблице (приложение 2.6), по тем же правилам, которые обсуждались в предыдущем разделе. НСР вычисляют путем перемножения соответствующей ошибки на коэффициент Тьюки ( 05).

Оценка достоверности различий между средними. Для проведения оценки строятся матрицы разностей между средними, и затем эти разности сравнивают с соответствующими НСР05. Если разность превышает величину НСР05, она считается достоверной.

Число матриц разностей средних может равняться трем, если оба фактора и их взаимодействие достоверно влияют на признак: 1) матрица разностей между средними по градациям фактора А; 2) матрица разностей между средними по градациям фактора В; 3) матрица разностей между средними по сочетанию градаций факторов А и В.

Итоговая результативная таблица. Сведение результатов двухфакторного дисперсионного анализа в итоговую таблицу (табл. 10.4.)

Таблица 10.4. Результаты двухфакторного дисперсионного анализа данных об изменчивости...

Источник вариации SS df ms σ2 Fэмп F05 F01 pin% НСР05
Общая SSy dfy - σy 2 - - - py in% -
Фактор А SSA dfA msA σA 2 FA F 05(A) F 01(A) pA in% НСР A
Фактор В SSB dfB msB σB 2 FB F 05(B) F 01(B) pB in% НСР B
Взаимодействие АВ SSAB dfAB msAB σAB 2 FAB F 05(AB) F 01(AB) pAB in% НСР AB
Случайные отклонения SSz dfz msz σe 2 - - - pe in% -

Выводы. Выводы должны содержать информацию по: 1) оценке достоверности влияния факторов и их взаимодействия; 2) долям влияния факторов, их взаимодействия и случайной вариации; 3) результатам оценки достоверности различий между средними по градациям достоверно влияющих факторов и их взаимодействия.

Пример 1. Изучали длину междоузлий (мм) в средней части однолетнего побега у деревьев 4-х сортов абрикоса на 3-х клоновых подвоях:

Сорт абрикоса

Клоновый подвой

ВВА-1 Дружба ВСГ
Краснощекий 62; 68; 64; 65;60 55; 42;51 53; 55; 50; 53
Никитский 55; 52; 49; 48 58; 65; 62; 64; 62 57; 59; 47; 53
Арзами 37; 36;42 56; 70; 67 40; 46;51; 55; 56
Венгерский 59; 58; 54 60; 53; 56 45; 57; 52

Какое влияние на длину междоузлий оказывают генотипические различия между сортами абрикоса, клоновые подвои и их взаимодействие?

Решение:

1. Копируем содержание таблицы в Excel

2. Строим дисперсионный комплекс

3. Определим основные параметры, суммы и компоненты формул:

объем комплекса (N) = 45

число градаций по фактору А (а) = 4

число градаций по фактору В (b) = 3

среднее число наблюдений по градациям фактора А (ni..)=

среднее число наблюдений по градациям фактора В (n.j.) =

среднее число наблюдений по сочетанию градаций АВ (nij.) =

137193

4. Вычислим суммы квадратов отклонений наблюдений от средних (SS):

=

=

Проверим корректность вычислений:

2822,31

5. Вычислим числа степеней свободы (df):

Проверим корректность вычислений:

6. Вычислим средние квадраты (ms):

 


 

Двухфакторный дисперсионный комплекс анализа изменчивости длины междоузлий однолетнего побега абрикоса (мм) в зависимости от сорта (фактор А) и клонового подвоя (фактор В)

 

Фактор А (сорт абрикоса)

Фактор В (клоновый подвой)

Σi..

ni..

xi..

ВВА-1

Дружба

ВСГ

длина междолузлий, мм

Σij.

nij.

xij.

длина междолузлий, мм

Σij.

nij.

xij.

длина междолузлий, мм

Σij.

nij.

xij.

Краснощекий

62

68

64

65

60

319

5

63,8

55

42

51

 

 

148

3

49,3

53

55

50

53

 

211

4

52,8

678

12

56,5

Никитский

55

52

49

48

 

204

4

51,0

58

65

62

64

62

311

5

62,2

57

59

47

53

 

216

4

54,0

731

13

56,2

Арзами

37

36

42

 

 

115

3

38,3

56

70

67

 

 

193

3

64,3

40

46

51

55

56

248

5

49,6

556

11

50,5

Венгерский крупный

59

58

54

 

 

171

3

57,0

60

53

56

 

 

169

3

56,3

45

57

52

 

 

154

3

51,3

494

9

54,9

Σ.j.

809

821

829

2459

45

54,6

n.j.

15

14

16

x.j.

53,9

58,6

51,8

 


7. Вычислим критерии Фишера (F):

8. Определим стандартные значения критерия Фишера для каждого фактора и их взаимодействия по таблицам (стат. табл. IV-V):

для фактора А: F05 (dfa=3; dfz=33)= 2,90; F01(dfа=3; dfz=33)= 4,48;

для фактора В: F05 (dfb=2; dfz=33)= 3,29; F01(dfb=2; dfz=33)= 5,33;

для взаимодействия АВ: (dfаb=6; dfz=33)= 2,39; F01(dfab=6; dfz=33)= 3,40;

9. Сравним эмпирические значения критерия Фишера со стандартными:

FA=4,08>F05=2,90; FA=4,08<F01=4,48;

FB=8,49>F05=3,29; FB=8,49>F01=5,33;

FAB=11,84>F05=2,39; FAB=11,84>F01=3,40;

10. Сформулируем статистические выводы:

по фактору А:нулевая гипотеза отклоняется на 5% уровне значимости и принимается на 1% уровне значимости;

по фактору В: нулевая гипотеза отклоняется на 1% уровне значимости;

по взаимодействию факторов АВ: нулевая гипотеза отклоняется на 1% уровне значимости.

11. Вычислим дисперсии (σ2) для тех факторов, которые достоверно влияют:

12. Вычислим доли влияния факторов (pin%):

13. Вычислим ошибки групповых средних по факторам и взаимодействию (mx), ошибки вычисляются только для тех средних, по которым доказано достоверное влияние фактора:

14. Определяем критерий Тьюки (Q05) по стат. табл.VI:

для фактора А: Q05(а=4; dfZ=33)=3,8

для фактора В: Q05(b=3; dfZ=33)=3,5

для взаимодействия АВ: Q05(аb=12; dfZ=33)=5,0

15. Вычисляем НСР05:

для фактора А: НСР05=

для фактора В: НСР05=

для взаимодействия АВ: НСР05=

16. Сводим все данные в результативную таблицу:

Результаты двухфакторного дисперсионного анализа данных об изменчивости длины междоузлий (мм) на однолетних побегах абрикоса в зависимости от генотипа сорта (фактор А) и клонового подвоя (фактор В):

Источник вариации

SS

df

ms

σ2

F

F05

F01

pin%

НСР05

Общая

2822,31

44

 

98,77

 

 

 

100

 

Фактор А (сорт)

259,39

3

86,46

5,80

4,08

2,90

4,48

6

5,2

Фактор В (подвой)

359,73

2

179,86

10,58

8,49

3,29

5,33

11

4,2

Взаимодействие АВ

1504,31

6

250,72

61,21

11,84

2,39

3,40

62

11,9

Случайная

698,88

33

21,18

21,18

 

 

 

21

 

17.Гистограммы групповых стредних:

Рис. 11.1. Групповые средние по градациям фактора А

Рис. 11.2. Групповые средние по градациям фактора В

Рис. 11.3. Групповые средние по градациям взаимодействия факторов АВ

18. Круговая диаграмма долей влияния факторов:

Рис.11.4. Доли влияния факторов

19. Проведем сравнение групповых средних между собой:

Матрица разностей групповых средних по фактору А

 

xi..

56,5 56,2 50,5 54,9

xi..

56,5   0,3 6,0 1,6
56,2     5,7 1,3
50,5       -4,4
54,9        

НСР05=5,2

Матрица разностей групповых средних по фактору В

 

x.j.

53,9 58,6 51,8

x.j.

53,9   -4,7 2,1
58,6     6,8
51,8      

НСР05=4,2

Матрица разностей групповых средних по взаимодействию АВ

 

х ij.

К-ВВА К-Д К-ВСГ Н-ВВА Н-Д Н-ВСГ А-ВВА А-Д А-ВСГ ВК-ВВА ВК-Д ВК-ВСГ
  х ij. 63,8 49,3 52,7 51,0 62,2 54,0 38,3 64,3 49,6 57,0 56,3 51,3
К-ВВА 63,8   14,5 11,1 12,8 1,6 9,8 25,5 -0,5 14,2 6,8 7,5 12,5
К-Д 49,3     -3,4 -1,7 -12,9 -4,7 11.0 -15,0 -0,3 -7,7 -7,0 -2,0
К-ВСГ 52,7       1,7 -9,5 -1,3 14,4 -11,6 3,1 -4,3 -3,6 1,4
Н-ВВА 51,0         -11,2 -3,0 12,7 -13,3 1,4 -6,0 -5,3 -0,3
Н-Д 62,2           8,2 23,9 -2,1 12,6 5,2 5,9 10,9
Н-ВСГ 54,0             15,7 -10,3 4,4 -3,0 -2,3 2,7
А-ВВА 38,3               -26,0 -11,3 -18,7 -18,0 -13,0
А-Д 64,3                 14,7 7,3 8,0 13,0
А-ВСГ 49,6                   -7,4 -6,7 -1,7
ВК-ВВА 57,0                     0,7 5,7
ВК-Д 56,3                       5,0
ВК-ВСГ 51,3                        

НСР05=11,9

20. Общие выводы по дисперсионному анализу:

1. Установлено достоверное влияние генотипа сорта привоя, клонового подвоя и их взаимодействия на изменчивость длины междозлий у однолетних побегов абрикоса. Однако, влияние клонового подвоя и взаимодействия «сорт-подвой» достоверно на 1% уровне значимости, но генотипа сорта – на 5% уровне значимости. Поэтому для уточнения достоверности влияния сорта привоя на длину междоузлий исследования следует продолжить.

2. Наиболее сильное влияние на длину междоузлий оказывает взаимодействие «сорт-подвой» (доля влияния 62%). Это означает, что сорта привои по разному реагируют на клоновые подвои. Вторым фактором по силе влияния является подвой (доля влияния составляет 11%). Наименее всего влияет сорт привой (доля влияния составляет 6%). Доля случайной вариации составляет 21%.

3. Наименьшей длиной междоузлий в среднем на всех подвоях характеризуется сорт Арзами (50,5 мм), наибольшей – сорт Краснощекий (56,5 мм). Сорт Арзами достоверно отличается по длине междоузлий от сортов Краснощекий и Никитский.

4. Наименьшей длиной междоузлий в среднем по всем привоям характеризуется подвой ВСГ (51,8 мм), наибольшей – подвой Дружба (58,6 мм). Подвой Дружба достоверно отличается по дине междоузлий от подвоев ВВА-1 и ВСГ.

5. Среди сорто-подвойных комбинаций следует отметить сочетание Арзами – ВВА-1, где наблюдается минимальная длина междозлий (38,3 мм). Максимальную длину междоузлий наблюдали у сорта Арзами на подвое Дружба (64,3 мм).

Практическое задание 10.1. Черенки туи западной обрабатывали препаратом «2У». Определите влияние типа раствора (спиртовой, органический №1, органический №2) и концентрации препарата (2 мл/л, 5 мл/л, 10 мл/л) на суммарную длину корней (см):

Тип раствора Концентрация

Суммарная длина корней, см

спирт. раствор

2 мл/л 18 72 56 68 32 46        
5 мл/л 42 14 48 8 12 48 6 46 48 24
10 мл/л 36 48 38 54 32 78 48 84    

орг. раствор 1

2 мл/л 102 86 98 64 62 32 64 64    
5 мл/л 18 56 46 16 28 46 56 38 28  
10 мл/л 53 32 18 46 14 96 24 18 26 84

орг. раствор 2

2 мл/л 64 12 8 14 46 48 54 62 52  
5 мл/л 22 64 42 36 28 24 68 26 18 18
10 мл/л 52 45 58 24 24 46 52      

Решение:

 

 




Понравилась статья? Добавь ее в закладку (CTRL+D) и не забудь поделиться с друзьями:  



double arrow
Сейчас читают про: