АК с алифатическими углеводородными радикалами, гидрофобные, незаряженные

Классификация аминокислот по растворимости их радикалов в воде, полярности, наличию или отсутствию заряда

Классификация и номенклатура аминокислот по строению радикалов

По строению углеродного скелета радикалов АК делятся на алифатические, ароматические и гетероциклические. В составе радикалов могут быть функциональные группы, придающие им специфические свойства: карбоксильная, амино-, тиольная, амидная, гидроксильная, гуанидиновая. Названия применяют преимущественно тривиальные (глицин от слова сладкий –glykos, серин от слова serieum – шелковистый, получен из фибрина шелка), для записи используют их трехбуквенное обозначение. В составе полипептидной цепочки остаток АК, не имеющий карбоксильной группы в стандартном блоке называется с изменением окончания –ИН на –ИЛ. Например глицил вместол глицин и т.д.

Сами АК все в воде растворимы, но в составе белка их радикал оказывает влияние на растворимость его в воде, поэтому важно выделить АК с гидрофобными неполярными и гидрофильными полярными радикалами. Гидрофобные радикалы это углеводородные структуры, которые способны «склеиваться» друг с другом образуя гидрофобные связи, но не образуют водородные или диполь-дипольные связи с водой и поэтому на растворяются в ней. Гидрофильные – образуют диполь-дипольные или водородные связи водой. Гидрофобные и гидрофильные радикалы АК определяют пространственное строение белка(конформацию), в который они входят.

Среди полярных радикалов также выделяют с зарядом (положительно и отрицательно заряженные) и без заряда. Радикалы с зарядом лучше растворяются в воде чем без заряда.