На сегодняшний день нельзя утверждать, что формирование системы органов специальной компетенции завершено. Достаточно сказать, что за последние 6-7 лет структура федеральных органов исполнительной власти, к которой относятся и упомянутые органы, претерпела несколько серьезных изменений, в результате которых одни природоохранные органы получили самостоятельный статус, другие же путем слияния реорганизовывались в комплексные органы.
Наиболее общей классификацией органов государственной власти в сфере природопользования и охраны окружающей среды являются деление их на органы общей и специальной компетенции. К первым на федеральном уровне относятся Президент РФ, Федеральное Собрание Правительство РФ; ко вторым — министерства, федеральные службы и федеральные агентства.
Установлено, что в ведении Министерства природных ресурсов и экологии Российской Федерации находятся:
Федеральная служба по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды,
Федеральная служба по надзору в сфере природопользования,
Федеральное агентство водных ресурсов
Федеральное агентство по недропользованию.