Эксперимент в отличие от наблюдения предполагает искусственное воспроизведение явления (его частей) или искусственное вмешательство в естественный ход процесса. Под экспериментом в эпидемиологии понимается искусственное вмешательство в процесс путем устранения гипотетически подозреваемых факторов, вызывающих болезни. В естественных условиях сама жизнь определяет, кто подвергается воздействию фактора, а кто нет. Задача исследователя состоит в том, чтобы увидеть различия по признаку воздействия и сравнить результат.
Математическое моделирование (количественная эпидемиология).
В ходе использования аналитических эпидемиологических методов осуществляется логическое моделирование – мысленное воспроизведение механизма развитие эпидемического процесса, согласующееся с фактическими материалами о его проявлениях. С помощью физического моделирования и других экспериментальных методов в эпидемиологии доказывается правильность логической модели. При достаточной изученности механизма развития эпидемического процесса осуществляется математическое воспроизведение (прогнозирование) проявлении эпидемического процесса для разных условии его развития.