Ориждин репликации E.coi. OriC

Наиболее подробно изучены ориджины у Е. соliи Bacillus subtilis. Область начала репликации хромосомы, оriС (origin of chromosome), включает в себя участки с так называемыми ДНК-боксами и расположенными между ними короткими последовательностями. ДНК-боксы со специфическим «мотивом» нуклеотидов, преимущественно в 9 пн, перемежаются фрагментами в 12-13 пн с высоким содержанием АТ. Сами 9-членные последовательности могут располагаться как в прямом, так и в инвертированном порядке по отношению друг к другу. Например, у В. subtilisимеется один фрагмент ТТАТССАСА и два других девягичленных бокса, ориентированных в противоположном направлении, с заменой одной из пар нуклеотидов. Всего у В. subtilisна оriС расположено 15 ДНК-боксов. Область оriС очень консервативна: ДНК-боксы сходного состава имеются в соответствующем месте хромосомы у других бактерий (хотя у Мусоp1аsma genitalium, несмотря на наличие общих для всех бактерий ферментов репликации, ДНК-боксов найдено не было). Сами ДНК-боксы не кодируют белок или РНК, хотя между ними располагаются отдельные гены. Продукты этих генов также большей частью вовлечены в «обслуживание» процесса репликации ДНК.

Схема абстрактного «минимального ориджина» прокариот представлена на рис. 3.