При обнаружении поражений или подозрительных очагов на стеблях, соломинках, листьях, зерне обнаруженный грибной налет соскабливают и переносят в каплю физиологического раствора или воды, находящуюся на предметном стекле, покрывают покровным и просматривают под микроскопом.
При поверхностном поражении можно применять метод смыва спор. Зерно, солому и сено предварительно измельчают, заливают чистой водой и в течение 20 мин взбалтывают. Если споры плохо смываются водой, то их встряхивают в шюттель-аппарате в течение 10 мин; после центрифугирования осадок исследуют обычным способом. Каплю суспензии пипеткой наносят на предметное стекло, покрывают и просматривают под микроскопом. При наличии спороношения микроскопическим исследованием смыва можно определить род (Fusarium, Aspergillus и др.), а иногда и вид гриба.