Кофермент, локализуясь в каталитическом участке активного центра, принимает непосредственное участие в химической реакции, выступая в качестве акцептора и донора химических группировок, атомов, электронов.
Кофермент может быть связан с белковой частью молекулы ковалентными и нековалентными связями. В первом случае он называется простетической группой (ФАД, ФМН, биотин, липоевая кислота).
Примером кофермента, связанного с ферментом нековалентной связью, является тиаминдифосфат, НАД+, НАДФ+.
Разнообразие коферментов
- Производные витаминов.
- Гемы, входящие в состав цитохромов, каталазы, пероксидазы, гуанилатциклазы, NO-синтазы и являющиеся простетической группой.
- Нуклеотиды – доноры и акцепторы остатка фосфорной кислоты.
- Убихинон, или кофермент Q, участвующий в переносе электронов и протонов в цепи переноса электронов.
- S-аденозилметионин – донор метильной группы.
- Глутатион, участвующий в окислительно-восстановительных реакциях.
Мультисубстратные реакции
- Механизм «пинг-понг» (механизм двойного замещения).
- Последовательный механизм (для протекания ферментативной реакции требуется одновременно взаимодействие двух субстратов).