1 пункт. Окисляемым веществом служат органические кислоты, являющиеся промежуточными продуктами различных видов обмена, в основном органические кислоты ЦТК. Органическая кислота окисляется путем дегидрирования под влиянием соответствующей дегидрогеназы. Для большинства субстратов дегидрогеназами, окисляющими непосредственно субстрат, являются пиридинферменты. Исключением являются такие субстраты, как сукцинат, α-глицерофосфат. Субстрат, теряя водороды, окисляется, а ПФ восстанавливается (его кофермент НАД переходит в НАДН2). НАДН2 теряет связь с апоферментом и отделяется от него.
Количество энергии, выделяемой на этом этапе, невелико.
2 пункт. НАДН2 окисляется флавопротеидами. Теряя водороды НАДН2, окисляется, а флавопротеиды, присоединяя водороды, восстанавливаются. На данном этапе происходит выделение 46 кДж энергии. Для образования макроэргической связи необходимо 33 кДж, поэтому на этом этапе биологического окисления происходит синтез одной молекулы АТФ и выделяется некоторое количество тепла.
3 пункт. ФПН2, окисляясь, отдает два водорода убихинону, убихинон (KoQ) восстанавливается (КоQН2)
4 пункт. По мере удаления от начала цепи связь между протоном и электроном в атоме водорода ослабляется, так как на каждом этапе окислительно-восстановительных реакций электрон отдает часть энергии. На уровне KoQH2 связь между протоном и электроном в атоме водорода окончательно ослабляется и происходит разрыв связи между протоном и электроном: 2Н→2Н++2е-. Протоны остаются в растворе, а электроны передаются Цх b.
5 пункт. Выделившиеся электроны присоединяются к двум ферриЦх b (Fe3+), которые восстанавливаются в ферроформу [2 Цхb(Fe2+)], где железо двухвалентное.
В пунктах 3, 4, 5 происходит выделение небольших количеств энергии, недостаточных для образования макроэргической связи и поэтому на данных этапах энергия рассеивается в виде тепла.
6 пункт. Происходит окислительно-восстановительная реакция между ферроЦхb и ферриЦхс1. Цхb окисляется, а Цхс1 восстанавливается. Этот этап сопровождается выделением 43 кДж с образованием второй молекулы АТФ и выделением тепла.
7 пункт. Две молекулы ферроцитохрома с1 отдают электроны феррицитохрому с. Цхс1 окисляется, a Цхс восстанавливается.
8 пункт. Окислительно-восстановительная реакция между 2Цхс (Fe2+) и 2 ферриЦха.
На этапах 7 и 8 происходит незначительное выделение энергии.
9 и 10 пункты очень тесно объединены между собой, так как происходят в мультиферментном комплексе — цитохромоксидазе. 2 ферроЦха передают 2е 2ферриЦха3. Цха окисляется, а Цха3 восстанавливается.
10 этап. Цха3 взаимодействует с молекулярным кислородом и окисляется, кислород ионизируется. Для восстановления кислорода необходимо 4е-, т. е. необходимо, чтобы прореагировали с кислородом 4 молекулы Цха3 (Fe2+).
4Цх а3 (Fe2+)+О2→4Цх а3 (Fe3+)+202-
9 и 10 пункты сопровождаются значительным выделением энергии (102 кДж) и большой теплопродукцией.
11 этап. Каждый активный ионизированный кислород реагирует с 2Н+, образовавшимися при окислении KoQH2 (4 этап) и образует Н2О.