Согласно Международной классификации, биокатализаторы делят на шесть главных классов, в каждом из которых несколько подклассов: 1) оксидоредуктазы; 2) трансферазы; 3) гидролазы; 4) лиазы; 5) изомеразы; 6) лигазы (синтетазы). В основу принятой классификации положен тип катализируемой реакции, который является специфичным для действия любого фермента.
Название энзима строится по следующей схеме: