В качестве доноров фосфатной группы ВР в реакции (2) могут принимать участие такие соединения, как ацетнлфосфат, L-фосфоаргннин, 4 фосфо-^-аспартат, карба мил фосфат, креатин-фосфат, 1,3-Дифосфо-О-глицерат, фосфоенолпируват, фосфор-амидат.
При использовании систем регенерации АТФ с участием фосфотра нефе раз удается осуществить практически полную регенерацию этого кофермента (с выходом более 95%).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Идеи иммобилизации биокаталиэаторов инициировали н стимулировали бурное развитие одного из важнейших направлении современной биотехнологии — инженерной энзимологни. Текущая (тактическая) задача инженерной энзимологин — это разработка (конструирование) биоорганических катализаторов с заданными свойствами на основе ферментов (в том числе с использованием пол я ферментных комплексов и даже целых клеток). Говоря о «заданных» свойствах, следует понимать, что они продиктованы потребностями практики; это, например» необходимое время службы катализатора при определенных условиях реакции (что зависит от его термостабильности, чувствительности к тем или иным факторам среды), избирательность (специфичность) действия, производительность (каталитическая активность), иммуногенность, токсичность, геометрическая форма препарата катализатора, его механические свойства и т. д.
|
|
Однако рамки инженерной энзимологни гораздо шире, чем создание катализаторов нового типа. Цель этой дисциплины, ее стратегическая задача состоит в том, чтобы разработать научные основы применения ферментативных катализаторов для создания новых биотехнологических процессов в промышленности, новых методов в терапии н медицинской диагностике» анализе, органическом синтезе и в других областях практической деятельности.
В качестве примера, наглядно иллюстрирующего разработку новых подходов к решению практических задач инженерной энзнмологни с привлечением методов иммобилизации, может служить проблема применения биокатализаторов для проведения реакций органического синтеза в среде органических растворителей с низким содержанием воды. Дело в том, что широкое приме нение ферментов в органическом синтезе существенно ограничивается тем, что ферменты, как принято считать, способны эффективно функционировать лишь в среде с высоким содержанием воды, В то же время в классическом органическом синтезе в качестве реакционной среды нашли применение самые разнообразные органические растворители. Имеется несколько кардинальных причин, которые делают необходимым использование органических растворителей как среды также и для фермента-
|
|
тивных реакций. Во-первых, при использовании органических растворителей решается проблема растворения гидрофобных реагентов, которая часто представляет трудно преодолимый барьер при проведении реакции в воде. Во-вторых, благодаря использованию органических растворителей термодинамическое равновесие многих ферментативных реакций сдвигается в сторону требуемых продуктов. Прежде всего это относится к тем реакциям, одним из продуктов которых является вода, в частности, к реакциям синтеза сложноэфирных, пептидных и амидных связей. В-третьих, применение органических растворителей снимает проблему бактериального заражения технологических установок, которая весьма остро стоит при использовании водных растворов.
Благодаря этим очевидным преимуществам в последние годы обозначился резко возросший интерес к проблемам биокатализа в неводных средах. Были предложены многочисленные и разнообразные подходы, направленные на конструирование биокаталитических систем, способных функционировать с исключительно малым содержанием воды. С точки зрения круга проблем, обсуждающихся в данном пособии, важным является то, что эти подходы в подавляющем большинстве случаев основаны в той или иной степени на различных способах иммобилизации {физической или химической) биологических катализаторов.
Методические аспекты инженерной энзимологнн во многом определены иммобилизационными подходами. В этой книге были рассмотрены лишь основные принципы получения иммобилизованных ферментов и влияние иммобилизации на свойства получаемых препаратов- Поэтому главная цель пособия будет достигнута, если у читателя пробудится интерес к этому разделу биотехнологии и появится желание дальнейшего изучения затронутых вопросов.
В заключение отметим, что в целом иммобилизация (как инструмент биотехнологии) сама по себе является достаточно развитой в методическом отношении, в будущем здесь следует ожидать лишь детализации отдельных приемов, а наибольший интерес и перспективы связаны с ее практическим использованием. И в этой связи хотелось обратить внимание, что идеи иммобилизации и ее методология приложимы не только к ферментам, но и многим другим соединениям, как высоко-, так и низкомолекулярным (гормонам, витаминам, лекарственным веществам и т. п.)-
ПРИЛОЖЕНИЕ
ПРИМЕРЫ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ МЕТОДИК
1. Иммобилизация три л си на на целлюлозе. 10 мл 6%-ного
раствора периодата натрия смешивают с 0,5 г целлюлозы. Пере
мешивают смесь в течение 3 ч> затем осадок отделяют и промы
вают водой. Промытый осадок помещают в 10 мл 0,1 М трисовогО
буфера, рН 6Д содержащего 10 мМ СаС1й для уменьшения авто
лиза, и добавляют фермент. Количество добавляемого трипсина
зависит от его удельной активности и, как правило, это 100 мг-
Смесь инкубируют при перемешивании в течение 1— 3 ч. Точное
время инкубации устанавливают экспериментально, определяя
удельную актшшость нативного трипсина и активность в супер-
натанте для расчета количества фермента, связавшегося с но
сителем. Пробы для измерения активности супериатанта следует
отбирать в процессе иммобилизации через каждые 20—30 мин.
Полученный препарат иммобилизованного фермента отделяют
фильтрованием, промывают буферным раствором и насыщенным
раствором мочевины для удаления не связавшегося с носителем
фермента. Высушенный на фильтре препарат иммобилизованного
трипсина может храниться в течение нескольких месяцев при
4°С практически без потери активности.
2. Определение ферментативной активности иммобилизован
ного трипсина. Определение проводят, измеряя скорость фермен-
тативного гидролиза этилового эфира Ы-бензоил-Ь-аргинина,
потенциометрически на рН-стате. Для этого из инкубационной
смеси отбирают пробы по 0,5—1,0 мл и помещают в ячейку
рН-стата, содержащую 10~3 М субстрата (рН около 7)т 0,1 М
KCI и 10 мМ СаОг- Измеряют активность отобранных проб,
учитывая фоновую реакцию гидролиза субстрата в отсутствие
фермента.
|
|
3. Ковалентная иммобилизация u-хнмотрипсина в полиакрил-
амндном геле. Процедура иммобилизации включает две стадии:
модификацию хлорангидридом акриловой кислоты и включение
в гель.
а) К раствору 5—20 мг химотрипсина в 10 мл 0,2 М фосфатного буфера, рН 8,0, при 0°С добавляют 10—100 мкл хлорангид-рида акриловой кислоты порциями по 10 мкл при интенсивном
перемешивании. После добавления каждой новой порции хлор-ангидрида акриловой кислоты инкубируют раствор в течение 5 мин, доводят рН до 8,0, добавляя концентрированный раствор КРН: затем вносят новую порцию модификатора. После завершения модификации раствор инкубируют при 0°С без перемешивания в течение 30 мин.
б) К раствору модифицированного фермента (10мл) последовательно добавляют 3*33 г акриламида, 0,2 г N,N'-метилен-бис-акрил амида и 0,1 мл 10%-ного водного раствора NTN,N',N'-тетраметилэтилендиамина, доводят рН до -8,0 концентрированной НС1 и далее добавляют 20 мг персульфата аммония в виде 20%-ного раствора. Раствор быстро (в течение нескольких секунд) перемешивают, разливают в тонкостенные стеклянные пробирки диаметром 5 мм и инкубируют в течение суток при 4°С. Полученный гель извлекают из пробирок, измельчают, растирая в ступке, и инкубируют в течение суток в 0,1 М трисовом буфере, рН 8,0, при 20°С. Суспензию переносят на стеклянный фильтр G-2 (пор-100), промывают несколькими объемами дистиллированной воды, высушивают гель на фильтре в течение нескольких минут. Удельная активность иммобилизованного а-химотрипсина составляет 0,1—0,3 мг фермента на I г геля.
4, Определение активности иммобилизованного а-химотрипси-
на„ Определение проводят потенциометрически, измеряя скорость
ферментативного гидролиза специфического субстрата этилового
эфира N-ацетшг-L-тирозина на рН-стате. Для этого навеску
иммобилизованного фермента (0,05—1,0 г) помещают в ячейку
рН-стата с 5—10 мл 5 мМ раствора субстрата в 0,1 М КС1
(рН 8,0) н измеряют активность препарата фермента, учитывая
фоновую реакцию гидролиза субстрата в отсутствие фермента.
|
|
5. Реактивация термоинактивированного иммобилизованного
трипсина. Препарат иммобилизованного трипсина (0т2—1 г)
после термоинактивации (остаточная активность 5—15% от
уровня активности препарата фермента до термоинактивации)
вносят в 4 мл раствора 10 М мочевины (рН 3) и инкубируют в
течение 30 мин. Затем доводят рН до 8,5 концентрированным
раствором КОН и в суспензию добавляют 1 мл 0,t M раствора
трисового буфера (рН 8,5), содержащего 10 мг дитиотреитола —
реагента, расщепляющего S—S-связи в белках. Суспензию ин
кубируют в течение 3 ч при 20°С в атмосфере инертного газа
(азота или аргона). После инкубации препарат иммобилизован
ного трипсина переносят на стеклянный фильтр G-3 (пор-40) и
промывают 1 мМ раствором НС! и 5%-ным раствором уксусной
кислоты несколько раз порциями по 10—20 мл до исчезновения
запаха дитиотреитола. Промывание препарата проводят в токе
инертного газа, ее продолжительность не превышает 10—15 мин.
Затем препарат помещают в 10 мл 0,1 М раствора трисового
буфера (рН 8,0), содержащего 10 мг ЭДТА и смесь глутатионов:
12 мг восстановленной формы и 2,4 мг окисленной формы. Инку
бацию иммобилизованного препарата в этих условиях проводят
в течение 1—2 сут при 20°С При этом происходит реактивация иммобилизованного трипсина на 70—100% от уровня исходной (до иммобилизации) активности фермента.
6. Микрокапсулнрование ферментов в полупроницаемые най~ лоновые оболочки методом межфазной полимеризации. К 0,75 мл 10%-ного раствора полиэтиленимина, рН которого доведен до 9,8, добавляют 0,75 мл 0,38 М раствора 1,6-гексаметилендиамнна в 0,8 М карбонатном буфере, рН 9,8. Раствор перемешивают, охлаждают до 0уС, растворяют в нем 15 мг и-химотрнпснна. К полученному 1%-ному водному раствору фермента в тефлоно-вом стаканчике объемом 100 мл, помещенном в ледяную баню, добавляют 7,5 мл охлажденной смеси хлороформа и циклогекса-на (1: 5 по объему), содержащей 1% по объему эмульгирующего агента Спан-85. Эмульгируют водный раствор фермента в органическом растворителе на магнитной мешалке при 0°С в течение 1 мин. Размер капсул определяется скоростью перемешивания и концентрацией Спан-85 — стабилизатора эмульсии.
К полученной эмульсии типа «вода в масле», не прекращая перемешивания, добавляют 7,5 мл охлажденного 18 мМ раствора себацнлхлорида в вышеназванной смеси органических растворителей. Раствор себаци л хлорида готовят непосредственно перед употреблением путем растворения 0,03 мл дихлорида в 7,5 мл смеси растворителей. В результате диффузии 1,6-гексаметилен-днамнна из волной в органическую фазу на поверхности раздела фаз образуется полимерная мембрана. Реакцию образования полимерной мембраны на поверхности эмульсионных капелек проводят в течение 3-^5 мин при перемешивании. Для прекращения реакции полимеризации к суспензии микрокапсул добавляют 15 мл вышеназванной смеси органических растворителей.
Полученную суспензию микрокапсул разливают в две центрифужные пробирки и добавляют в каждую по 10 мл 15%-кого раствора Спан-85 в смеси хлороформа н циклогексана в объемном соотношении 1:3. Суспензию перемешивают палочкой и центрифугируют при 8000 об/мин в течение I—2 мин, супернатант удаляют.
Микрокапсулы диспергируют в 15 мл 50%-кого водного раствора Твнн-20 на магнитной мешалке в течение 1 мин при максимальной скорости перемешивания. К полученной суспензии порциями добавляют 130 мл воды при перемешивании на магнитной мешалке в 0,5 л стеклянном стакане {по мере добавления воды постепенно снижают скорость перемешивания).
Суспензию центрифугируют при 8000 об/мин в течение 2— 3 мин. Супернатант удаляют, микрокапсулы промывают раствором НО, рН 3,0, до исчезновения ферментативной активности в фильтратах. Полученные микрокапсулы хранят в виде суспензии в 1 мМ НС1 при 4СС. Размеры полученных микрокапсул 10— 15 мкм.
7. Ми крокапсулнро вание ферментов в поликарбонатные оболочки методом двойного эмульгирования. К Юмл 10%-ного
шта в метилен хлориде при интенсивном перемешивании быстро по каплям добавляют 2 мл 1%-ного водного раствора фермента {рН 3,0), содержащего 5% полиэтилен-амина. Эмульгирование проводят в течение 1 мин. К полученной первичной эмульсин, не прекращая перемешивания, постепенно приливают 50 мл 2%-ного раствора поливинилового спирта — стабилизатора эмульсии в 0,5 JVL ацетатном буфере, рН 4 J. Про* должают перемешивание в течение 2,5—3 ч при комнатной температуре. За это время метилен хлорид полностью испаряется, н на поверхности водных капелек фермента образуется твердая полупроницаемая полимерная оболочка- Микрокапсулы отделяют и промывают 1 мМ раствором HCI на воронке со стеклянным пористым фильтром.
8. Солюбилнэация ферментов в обращенные мицеллы поверх
ностно-активных веществ в органических растворителях. К 2 мл
0,1 М раствора Аэрозоля ОТ в октане добавляют 5—150 мкл
10—50 мМ водного буферного раствора, рН 3—11 (концентрация
не должна превышать 50 мМ, при наличии высокой ионной силы
следует использовать буферный раствор с более низкой концен
трацией). Смесь интенсивно встряхивают до образования опти
чески прозрачного раствора. Для ускорения процесса образова
ния прозрачного раствора, содержащего большие количества
буферного раствора, добавляют буферный раствор порциями по
2—3% (40 -G0 мкл). Далее добавляют Б— 20 мкл водного
раствора фермента и опять интенсивно встряхивают до образо
вания оптически прозрачного раствора. Фермент можно вносить
н в виде навески сухого обессоленного порошка, однако время
растворения фермента в этом случае в системе обращенных
мицелл с низким содержанием воды (меньше 2%) существенно
увеличивается (от нескольких десятков секунд при внесении
водного раствора белка до десятков минут и даже часов
при внесении сухого белка). Для солюбнлизации белка и опре
деления активности включенного фермента наиболее широко
используются растворы Аэрозоля ОТ в октане в концентрациях
от 30 до 300 мМ,
9. Получение нанегранулированного смшмотрипсина. К 5 мл
0,235 М раствора Аэрозоля ОТ в толуоле добавляют 100 мг
акриламнда н 25 мг Ы,Ы'-метнлен-бнс-акриламнда в 200 мкл
воды и инициатор радикальной полимеризации, азо-бис-изобу-
тиронитрил, из раечсти О, i мг/мл Смесь встряхивают в течение
15—30 мин до полной солюбилизацни. Затем к полученному
раствору добавляют 100 мкл концентрированного (0,5 мМ) вод
ного раствора акрнлоилнрованного сс-хнмотрнпсина (см. его
получение в примере 3) и после встряхивания получают одно
родный прозрачный раствор обращенных мицелл Аэрозоля ОТ
в толуоле, содержащий солюбилизованные мономеры.
Полимеризацию инициируют облучением деаэрированного мицеллярного раствора УФ-светом (ксеионовая лампа ХВО-200, расстояние от источника 33 см, толщина слоя раствора 1см).
Для завершения полимеризации облучение продолжают в течение 10 мин.
После проведения полимеризации мнцеллярную систему разрушают добавлением 10-кратного избытка ацетона. При этом полимерные наногранулы (размер менее 100 нм в диаметре) выпадают в осадок, а растворимые в ацетоне непрореагировавшие мономеры и Аэрозоль ОТ удаляют с супернатантом. Полученный сухой порошок наногранулированного а-хнмотрипснна обладает до 40—60% ферментативной активности (от исходной), может храниться практически без потери активности в течение полугода при 4°С, растворим как в воде, так и в мицеллярных растворах в органических растворителях.
10, Гидрофобнзацнн белков (на примере сс-хнмотрипснна) для целей нековалентной иммобилизации на гидрофобных носителях (биомембранах). К 10 мл 0,1 М раствора Аэрозоля ОТ в октане добавляют 450 мкл 33 мМ боратного буфера, рН 9,0. Раствор интенсивно встряхивают в течение I—2 мин, солюбнлизуют в нем 20—50 мг препарата лиофилизованного фермента, затем добавляют —100 мкл раствора стеароилхлорида в 0,1 М Аэрозоле ОТ в октане (соотношение стеароил хлорид — белок составляет 2:1). Раствор перемешивают в течение 20—30 мин,
Из реакционной системы белок осаждают на холоду добавлением двойного объема ацетона, выпавший осадок белка отделяют и встряхивают с 20 мл холодного ацетона для отмывки от примесей октана и Аэрозоля ОТ. Эту операцию повторяют 2—3 раза. Остаток ацетона удаляют на роторном испарителе (18°С) или током воздуха. Выход по белку контролируют по массе н спектро-фотометрнческн (280 нм).
Фракционирование стеароилированного химотрипсина прово
дят на колонке (объем 210 мл) с сефядексом G-50, уравновешен
ным I мМ НС1. И-л колонку наносят 10—20 мл 20 мкМ раствора
белка» рН ЗД Гидрофильную фракцию элюируют I мМ HClt
гидрофобную — 0,5%-ным раствором Бридж 35, рН ЗД Выход
модифицированного белка составляет %
ЛИТЕРАТУРА
Основная:
Введение в прикладную энзимол огню/Под ред. И. В. Березина и К. Марти-неха. — М.: Изд-во МГУ, 1962. 384 с.
Иммобилизованные ферменты //Современное состояние и перспективы /Под ред. И В. Березина, В. К. Антонова и К. Мартннека.— М.: Изд~во МГУ, 1976, Т. U 2. 296 с: 358 с.
Тривен М. Иммобилизованные ферменты.—М.: Мир, 1983. 213 с.
Лурье А. А. Хромат о графические материалы. ■— М.: Химия, 1978.
Коршак в. В., Штильман М. И. Полимеры в процессах иммобилизации модификации природных соединений. — М.: Наука, 1984. 261 с.
Handbook of Enzyme Biotechnology Ed by A. Wiseman 2-nd edition — Chichester: John Witey and Sons, 1985, 437 p.
Methods in Ensymotogy//Immobilized Enzymes/Ed by K. Mosbch, — New York: Academic Press, 1976. Vol. 44, 999 p.
Rosevear A. Immobilized biocataly&ts— a critical review//J. Chem. Techno]. Biotechnol. 1984. 34 B. P. 127—150.
Gtazer A. N. The chemical modification of proteins by groupspeciHc and site-specific reagents//In: The Protein. (H. Neurath, R. L. HiU, Eds). — New-York. Academic Press, 1976. VoL 2. P. 1-103.
Дополнител ъ «ал:
Береэин И, fl., Мартинек К. Основы физической химии ферментативного катализа. — М.: Высшая школа, 1977. 280 с.
Курганов Б. И. Алл остер нческие ферменты. — М.: Наука, 1978. 248 с.
Остерман Л. А. Хроматография белков и нуклеиновых кислот. — М.: Наука, 1985. 536 с.
Поверхностные явления и поверхностно-активные вещества/Под ред. А. А. Абрамэона и Е. Д. Щукина. — М.: Химия, 1984. 392 с.
Мартинек К., Березин И, В, Стабилизация ферментов — ключевой фактор при внедрении биокаталнэа в практику //Успехи химии. 1980. Т. 49. С. 737—770.
Можаея В. R. Иммобилизации ферментов как новый подход к решению фундаментальных проблем энзимологни//Успехи биологической химии. 1983. Т. 24. С 99—134.
Хмельницкий Ю. Л., Левашов А. В., Ка&чко И. Л., Мартинек К- Микрогетерогенная среда для химических (ферментативных) реакций на основе коллоидного раствора ноды в органическом растворителе//Успехи хиадин. L984. Т. 53. С. 54В 5G5.
Мартинек /(-, Левашов А. В., Каячко И. Л„ Хмельницкий Ю, Л., Береэин И. В. Мицеллнрнан энэимологня. Бнол. мембраны. Т. 2. 1985. С. 669—696.
Исторический очерк
Ьиокаталнз//Истории моделирования опыта живой при роди /Церезин И. В., Кузнецов В. И, Варфоломеев С. Д. и др. М.: Наука, 1981. 344 с.
ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ
Автолиз 121, 122