Факторы фолдинга

Фолдинг белков изучают следующим образом: вначале разрушают нативную структуру с помощью специальных агентов, т.е. вызывают его денатурацию, а затем наблюдают за восстановлением исходной структуры (ренатурацией или рефолдингом). О состоянии белка судят с помощью разнообразных спектральных методов, а также по его функциональной активности. Такие эксперименты показали, что ренатурация эффективно происходит для небольших белков, например рибонуклеаза. В случае более крупных белков денатурация часто сопровождается агрегацией, а самопроизвольный рефолдинг если и происходит, то очень медленно и с весьма небольшим процентом выхода. Вместе с тем показано, что добавление в среду некоторых белковых фракций клетки значительно облегчает рефолдинг денатурированных белков.

Отсюда и возникло представление о вспомогательных белках (или факторах) фолдинга. Данные факторы разделяют на 2 группы:

1. белки с каталитической активностью, т.е. ферменты фолдинга – фолдазы. Как и прочие ферменты, они требуются лишь в каталитических количествах, т.е. в концентрациях, на порядок меньше, чем у «обслуживаемых» ими белков.

2. молекулярные шапероны - белки с разными механизмами действия, объединенные на основании того, что они требуются в количествах, близких к стехиометрическим, т.е. сравнимых по величине с концентрацией сворачиваемых белков, но как и фолдазы они не входят в состав конечных продуктов фолдинга.