Bin I GGATC(N)4
CCTAG(N)5
Fok I GCATG(N)9
CCTAC(N)13
Hga I GACG(N)5
CTGCG(N)10
Hpb I GGTG(N)8
CCACT(N)7
Mbo II GAAGA(N)8
CTTCT(N)7
Mnl I CCTC(N)7
GGAG(N)7
Sfa NI GCATC(N)5
CGTAG(N)9
Tth 111I CAAACA(N)11
GTTTGT(N)9
* Наведені послідовності двох ланцюжків ДНК, причому верхня відповідає 5′ → 3′-напрямку.
Приклади задач
1. Яка з двох рестриктаз, Bam HI чи Hae III, внесе більше розривів в молекулу ДНК, що являє собою випадкову послідовність нуклеотидів? Поясніть.
Розв’язання.
Рестриктаза Bam HI впізнає гексануклеотидну послідовність, а рестриктаза Hae III впізнає тетрануклеотидну послідовність. Сайт для рестрикції Hae III зустрічається приблизно через кожні 256 п.н. (44), а сайт рестрикції для Bam HI через кожні 4069 п.н. (46). Безумовно в ДНК, яка є випадковою послідовністю нуклеотидів рестриктаза Hae III зробить більше розривів.
2. “Липкий кінець”, утворений рестриктазою Bam HI, зшивають з “липким кінцем”, утвореним рестриктазою Bgl II. Який сайт рестрикції залишиться (утвориться) при зшиванні?