Он включает 5 стадий:
1. назначение экспертизы;
2. сбор, обобщение и оценка информации;
3. формирование предварительного заключения и ознакомление с ним общественности;
4. утверждение заключения руководителем компетентного органа;
5. разрешение споров.
Ответственность за экологическое правонарушение наступает в трех случаях:
1. Ответственность экспертов за заведомо неправильное заключение либо выводы, сделанные в результате небрежного анализа доказательств. В этих случаях возможно привлечение к уголовной ответственности за должностные преступления: злоупотребление служебным положением и халатность.
2. Ответственность предприятий, учреждений, граждан за невыполнение решений экспертизы. Здесь применяется административная ответственность в виде крупного штрафа, накладываемого по постановлению органов охраны окружающей среды на должностных лиц, граждан, юридических лиц, виновных в неисполнении предписания экологической экспертизы.
3. Ответственность третьих лиц, которые понуждали или пытались понуждать к изменению выводов экспертизы. В качестве ответчиков могут выступать лишь должностные лица, которые могут быть привлечены к административной или уголовной ответственности.