Состав и аминокислотная последовательность

При единообразно построенной полиамидной цепи специфичность пептидов и белков определяется двумя важнейшими характеристиками - аминокислотным составом и аминокислотной последовательностью.

Аминокислотный состав пептидов и белков - это природа и количественное соотношение входящих в них α-аминокислот. Первичная структура пептидов и белков - это аминокислотная последовательность, т. е. порядок чередования α-аминокислотных остатков.

Амидные связи способны гидролизоваться как в кислой, так и щелочной среде. Пептиды и белки гидролизуются с образованием либо более коротких цепей - это так называемый частичный гидролиз, либо смеси аминокислот (в ионной форме) - полный гидролиз. Обычно гидролиз осуществляют в кислой среде, так как в условиях щелочного гидролиза многие аминокислоты неустойчивы.

Общую формулу пептидов можно представить следующим образом:

Один конец, на котором находится аминокислота со свободной NH₂ группой называют N-концом, другой, на котором находится аминокислота, имеющая свободную -СООН группу, называют С-концом. Пептидные и белковые молекулы принято записывать, начиная с N-конца. При построении названий пептидов в названии аминокислот окончание -ин заменяется на -ил, а название аминокислоты, содержащей свободную карбоксильную группу, остается без изменения.

При построении белковых молекул с диамино- или дикарбоновыми аминокислотами в образовании пептидной связи участвуют α-NH₂ или α- СООН группы.

O               O

║ ║

Н₂N – СН₂ – С – N – CH – C – N – CH – COOH