Синтез пептидов. Определение конформации молекул

Определение конформации молекул.

Наибольшее применение нашли два метода – рентгеноструктурный анализ для кристаллических соединений и ядерный магнитный резонанс для соединений, находящихся в растворе.

Рентгеноструктурный анализ третичной структуры белков основан на дифракции рентгеновских лучей на хорошо сформированных белковых кристаллах. На основании дифракционных картин рассчитывают распределение электронной плотности в кристалле, а по электронной плотности восстанавливают пространственную структуру молекул белка с атомным разрешением. В настоящее время определены трехмерные структуры сотен белков. Однако многие белки пока нельзя изучить этим методом, поскольку их не удается получить в виде хорошо сформированных кристаллов достаточно крупных размеров.

В лабораторных условиях пептиды могут быть получены разнообразными методами, общей чертой которых является обязательная защита в одной из реагирующих аминокислот аминной, а в другой – карбоксильной группы. При выборе блокирующего агента руководствуются возможностью его легкого отщепления без изменения структуры пептида.

Наибольшую известность приобрел метод твердофазного синтеза пептидов Р.Меррифилда. Карбоксигруппу исходной аминокислоты защищают присоединением к полимеру, а аминогруппу присоединяемой кислоты – трет-изобутилоксикарбонильным (БОК) радикалом.

Твердофазный синтез удалось автоматизировать, в результате появились автоматизированные синтезаторы пептидов, которые с успехом используются в промышленности и в лабораторной практике.