Во время «Пятилетки безбожия»

В феврале 1932 года было объявлено о выполнении Первой пятилетки и утверждении Второго пятилетнего плана. 15 мая «Союз воинствующих безбожников» принял свой «пятилетний план»: в первый год закрыть все духовные школы (к этому времени они оставались только у обновленцев); во второй - провести массовое закрытие храмов, запретить издание религиозных сочинений и изготовление предметов культа; в третий год выслать всех служителей культа за границу; в четвёртый - закрыть оставшиеся храмы всех религий и, наконец, в пятый - закрепить достигнутые успехи.

Воинствующие атеисты утверждали, что к 1 мая 1937 года «имя Бога должно быть забыто на всей территории СССР».

Число действующих храмов сокращалось катастрофически. В Ленинградской епархии за год закрыли 355 церквей, в Горьком за два года - 305 церквей, во Владивостоке в 1932 году осталась одна церковь, да и та в доме священника, где службы совершались тайно. В Самаре и Тамбове к 1933 г. было по одному действующему храму, в Хабаровске в это время закрыли последний. В Москве к 1933 г. в юрисдикции Московского Патриархата осталось 87 храмов. Ещё не арестованные священники закрытых церквей совершали богослужения по домам православных. В марте 1933 года в Казани за нелегальные богослужения приговорили к высшей мере настоятельницу Феодоровского монастыря игуменью Софию, нескольких монахов, монахинь и мирян. Иноков, бежавших из разорённых обителей, вылавливали и отправляли в лагеря, В 1933 году таким образом была «очищена» от насельников Оптина пустынь.

В годы Второй пятилетки репрессии впервые коснулись видных деятелей обновленчества. В 1934 году был арестован и скончался в заключении один из его основателей Александр Боярский. 29 апреля 1935 года обновленческий синод принял решение о самоликвидации. Участники заседания передали всю полноту власти «первоиерарху православных церквей СССР» митрополиту Виталию (Введенскому). Ему присвоили титул «первосвященнейший», а так же наделили правом назначать себе преемника и делегировать свои полномочия другому епископу. Были распущены епархиальные управления и благочиннические советы. Остались лишь архиереи и их канцелярии.

Новая волна гонений против верующих в СССР также не осталась без внимания за рубежом. В ответ на резкую критику в свой адрес, 22 июня 1934 года Заместитель Патриаршего местоблюстителя митрополит Сергий (Страгородский) издал указ о запрещении в священнослужении митрополита Антония (Храповицкого) и нескольких зарубежных иерархов. Архиерейский Синод Зарубежной Церкви не признал данного постановления. Разделение сохранялось и после смерти Первоиерарха Русской Зарубежной Церкви митрополита Антония (Храповицкого), последовавшей в 1936 году, преемником которого на посту Председателя Архиерейского Синода Русской Зарубежной Церкви стал митрополит Анастасий (Грибановский) (1936-1964),

27 апреля 1934 года Синод и группа архиереев (всего 21 человек) присвоили Заместителю Местоблюстителя титул «Блаженнейшего митрополита Московского и Коломенского». Для признания его Первоиерархом оставалось одно препятствие – был жив Местоблюститель Патриаршего престола митрополит Пётр (Полянский), первым поминаемый всей полнотой Русской Православной церкви, как принявшими, так и отвергающими Декларацию 1927 года.

Отказываясь от сотрудничества с Советской властью, святитель Пётр продолжал свой мученический путь. В апреле 1927 шестидесятичетырёхлетнего узника сослали в Заполярье, на берег Обской реки в посёлок Ход в двухстах вёрстах от города Обдорска. Срок неправедного приговора заканчивался в конце 1928 года. Однако без всякой мотивировки ссылка была продлена.

В августе 1930 года святителя Петра доставили сначала в Тобольскую, а через 3 месяца в Екатеринбургскую тюрьму. От него требовали отказаться от местоблюстительства, обещая при этом облегчить дальнейшую участь. Хорошо понимая последствия своих действий, святитель отказывается от сделки. Не сломили его заключение в одиночную камеру и непрерывные допросы.

23 июля 1931 года особое совещание ГПУ выносит решение: «Постановили - Полянского - Крутицкого Петра Феодоровича заключить в концлагерь сроком на пять лет, считая срок с момента вынесения настоящего постановления». И это решение не сломило узника. Несмотря на приговор, его переводят в Верхне-Уральскую тюрьму особого назначения с анонимным учётом заключённых (только номер камеры и номера заключённого). Его поместили в 23-ю камеру под номером 114. 9 июля 1936 года на заседании особого совещания уже при НКВД СССР, срок заключения был продлён в очередной раз - на 3 года.

В декабре 1936 года, когда святитель Пётр был ещё жив, митрополиту Сергию объявили о том, что он может отныне называть себя Патриаршим местоблюстителем. Это известие было истолковано как сообщение о смерти в заключении Предстоятеля Русской церкви. В связи с этим 27 декабря Патриархией был издан «Акт о переходе прав и обязанностей Местоблюстителя патриаршего престола Православной Российской Церкви к Заместителю патриаршего Местоблюстителя, Блаженнейшему митрополиту Московскому и Коломенскому Сергию (Страгородскому)». Был издан также указ Московской Патриархии о форме поминовения за богослужением патриаршего Местоблюстителя митрополита Сергия.

Поздравление по этому случаю, пришедшее от митрополита Японского Сергия (Тихомирова), едва не привело к аресту нового Местоблюстителя. Было начато дело по обвинению митрополита Сергия в шпионаже в пользу Японии. В качестве доказательств использовались пребывание его в Японии с 1890 по 1893 и с 1897 по 1899 гг., также хорошее знание японского языка. Дело в итоге закрыли, но 18 мая 1935 года вышел указ о роспуске Временного Патриаршего Синода. После этого управление всеми епархиями Русской Церкви осуществлялось лично митрополитом Сергием с помощью викарного архиерея, епископа Дмитровского Сергия (Воскресенского). Вся патриаршая канцелярия в это время состояла из секретаря и машинистки.

Митрополит Пётр (Полянский) был в это время ещё жив. Но уже осенью 1937 года его приговорили к смертной казни за то, что он «клеветнически обвинял органы НКВД в пристрастном к нему отношении» и «пытался связаться с внешним миром из заключения, используя для этого медицинский персонал тюрьмы, в результате чего получил от духовенства г. Верхнеуральска просфору как знак привета».

10 октября 1937 года в 4 часа дня митрополит Крутицкий Пётр (Полянский) был расстрелян.