Для обратимых процессов отношение:
;
– функция состояния системы, названная энтропией, равна:
,
Второй закон термодинамики в дифференциальной форме:

, так как в изолированной системе:
.
Энтропия имеет вероятностную природу:
,
где
- постоянная Больцмана,
Дж К -1,
а
,
причем
- число вероятных состояний системы.
Таким образом, I-й закон ТД определяет энергетический баланс в закрытой системе, а II-й – дает возможность установить направленность термодинамического процесса.
Термодинамические потенциалы
По изменению
и
нельзя оценить величину производимой работы, их начальных и конечных значений. Для этого и вводят термодинамические потенциалы, которые выводятся из объединенной записи I-го и II-го законов термодинамики.
Объединённая запись I и II законов ТД.

Видно, что изменение внутренней энергии складывается из двух компонентов:
- совершаемая работа – это свободная энергия,
– рассеянная в виде тепла – связанная энергия.
Для количественной оценки свободной энергии необходимо наложить ограничения:
1. При постоянном давлении P, работа по изменению объёма будет равна
, а количество теплоты, согласно I-му закону ТД:

будет отражать изменение энтальпии – теплосодержание системы.

Т.е. энтальпия равна количеству теплоты, выделяемой системой.
Зная энтальпию исходных веществ и продуктов реакции и основываясь на законе Гесса, можно определить её тепловой эффект (см. стр.12)
2. При постоянных V и T рассчитывается свободная энергия Гельмгольца.
Совершаемая работа условно состоит из 2-х компонент:

так как
,
- свободная энергия Гельмгольца.

3. При постоянных P и T рассчитывается свободная энергия Гиббса:
–свободная энергия Гиббса, и она равна:

Так как в биологических системах
, чаще используют энергию Гиббса.
Следствия I и II –го законов ТД.
1. Необратимый процесс всегда сопровождается рассеянием энергии в тепло
;
2. Если
или
, то процесс самопроизвольный и необратим, если
и
, то процесс не самопроизвольный и обратимый.
3. При достижении равновесия
и
, а
и 
Закон Вант – Гоффа
Для идеального газа с учетом того, что свободная энергия Гиббса при полном дифференциировании: dG = dU + pdV + VdP – TdS – SdT = VdP-SdT, где:
dG = VdP-SdT
и постоянной температуре, получим:

Если первое состояние – в стандартных условиях и имеет стандартную величину
, то итоговое значение свободной энергии Гиббса будет равно:
.
Для разбавленных растворов
(концентрация) и тогда:
.
Для простого процесса
в состоянии равновесия
, тогда,

а так как
=
(константа равновесия), получаем:
– закон Вант – Гоффа
(
- изменение
при протекании процесса в стандартных условиях).
В биологических системах процессы обычно сопровождаются еще изменением количества вещества и в таком случае:
,
где
- изменение числа частиц,
- химический потенциал (градиент).
.
Химический потенциал равен изменению термодинамического потенциала, приходящегося на одну частицу вещества в соответствующем процессе. Он не является термодинамическим потенциалом и служит параметром системы.

Все выше изложенное разработано для закрытых и изолированных систем, находящихся в состоянии термодинамического равновесия. При этом состоянии, когда:
, процессы не протекают, материя мертва, так как система не может самопроизвольно выйти из этого состояния.
Живые системы находятся в стационарном состоянии. При этом скорость протекания процессов остается постоянной, то есть:
, но
и
, а
(здесь
и
становятся функциями от времени).
Равновесие в живой системе поддерживается за счет баланса протекающих процессов.